Protein–RNA interactions for Protein: P05556

ITGB1, Integrin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB1P05556 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGB1P05556 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGB1P05556 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGB1P05556 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGB1P05556 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGB1P05556 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGB1P05556 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGB1P05556 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGB1P05556 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGB1P05556 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGB1P05556 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGB1P05556 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGB1P05556 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGB1P05556 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGB1P05556 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGB1P05556 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGB1P05556 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGB1P05556 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGB1P05556 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGB1P05556 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGB1P05556 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGB1P05556 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGB1P05556 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGB1P05556 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGB1P05556 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGB1P05556 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGB1P05556 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGB1P05556 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGB1P05556 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGB1P05556 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGB1P05556 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGB1P05556 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGB1P05556 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGB1P05556 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGB1P05556 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGB1P05556 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGB1P05556 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGB1P05556 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGB1P05556 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGB1P05556 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGB1P05556 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGB1P05556 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGB1P05556 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGB1P05556 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGB1P05556 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGB1P05556 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGB1P05556 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGB1P05556 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGB1P05556 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGB1P05556 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGB1P05556 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGB1P05556 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGB1P05556 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGB1P05556 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGB1P05556 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGB1P05556 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGB1P05556 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGB1P05556 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGB1P05556 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGB1P05556 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGB1P05556 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGB1P05556 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGB1P05556 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGB1P05556 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGB1P05556 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGB1P05556 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGB1P05556 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGB1P05556 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGB1P05556 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGB1P05556 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGB1P05556 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGB1P05556 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGB1P05556 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGB1P05556 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGB1P05556 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGB1P05556 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGB1P05556 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGB1P05556 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGB1P05556 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGB1P05556 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGB1P05556 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGB1P05556 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGB1P05556 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGB1P05556 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGB1P05556 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGB1P05556 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGB1P05556 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGB1P05556 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGB1P05556 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGB1P05556 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGB1P05556 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGB1P05556 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGB1P05556 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGB1P05556 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGB1P05556 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGB1P05556 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGB1P05556 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGB1P05556 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGB1P05556 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGB1P05556 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms