Protein–RNA interactions for Protein: P02748

C9, Complement component C9, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9P02748 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9P02748 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9P02748 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9P02748 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9P02748 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
C9P02748 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9P02748 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9P02748 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9P02748 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9P02748 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9P02748 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9P02748 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
C9P02748 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9P02748 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9P02748 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9P02748 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9P02748 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9P02748 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9P02748 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9P02748 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9P02748 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9P02748 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9P02748 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9P02748 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9P02748 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9P02748 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9P02748 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9P02748 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9P02748 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9P02748 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9P02748 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9P02748 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9P02748 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9P02748 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9P02748 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9P02748 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9P02748 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9P02748 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9P02748 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9P02748 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9P02748 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9P02748 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C9P02748 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C9P02748 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C9P02748 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C9P02748 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C9P02748 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C9P02748 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
C9P02748 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C9P02748 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C9P02748 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9P02748 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9P02748 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9P02748 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9P02748 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
C9P02748 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9P02748 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9P02748 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9P02748 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9P02748 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9P02748 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9P02748 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9P02748 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9P02748 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9P02748 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9P02748 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9P02748 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
C9P02748 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9P02748 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9P02748 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9P02748 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9P02748 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9P02748 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9P02748 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
C9P02748 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9P02748 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9P02748 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9P02748 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9P02748 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9P02748 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9P02748 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9P02748 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9P02748 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9P02748 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9P02748 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9P02748 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9P02748 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
C9P02748 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9P02748 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9P02748 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9P02748 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
C9P02748 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9P02748 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
C9P02748 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C9P02748 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C9P02748 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
C9P02748 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C9P02748 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C9P02748 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C9P02748 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms