Protein–RNA interactions for Protein: O95239

KIF4A, Chromosome-associated kinesin KIF4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4AO95239 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KIF4AO95239 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KIF4AO95239 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KIF4AO95239 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KIF4AO95239 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KIF4AO95239 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KIF4AO95239 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KIF4AO95239 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KIF4AO95239 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KIF4AO95239 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KIF4AO95239 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KIF4AO95239 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KIF4AO95239 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KIF4AO95239 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KIF4AO95239 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KIF4AO95239 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KIF4AO95239 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KIF4AO95239 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KIF4AO95239 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
KIF4AO95239 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KIF4AO95239 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KIF4AO95239 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KIF4AO95239 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KIF4AO95239 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KIF4AO95239 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KIF4AO95239 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KIF4AO95239 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KIF4AO95239 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KIF4AO95239 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
KIF4AO95239 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KIF4AO95239 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KIF4AO95239 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KIF4AO95239 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KIF4AO95239 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KIF4AO95239 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KIF4AO95239 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KIF4AO95239 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KIF4AO95239 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KIF4AO95239 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KIF4AO95239 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KIF4AO95239 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KIF4AO95239 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KIF4AO95239 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KIF4AO95239 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KIF4AO95239 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KIF4AO95239 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KIF4AO95239 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KIF4AO95239 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KIF4AO95239 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KIF4AO95239 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KIF4AO95239 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KIF4AO95239 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KIF4AO95239 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KIF4AO95239 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KIF4AO95239 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KIF4AO95239 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KIF4AO95239 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KIF4AO95239 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KIF4AO95239 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KIF4AO95239 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
KIF4AO95239 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KIF4AO95239 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KIF4AO95239 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KIF4AO95239 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
KIF4AO95239 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KIF4AO95239 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KIF4AO95239 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KIF4AO95239 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KIF4AO95239 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KIF4AO95239 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KIF4AO95239 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KIF4AO95239 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KIF4AO95239 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KIF4AO95239 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KIF4AO95239 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KIF4AO95239 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KIF4AO95239 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KIF4AO95239 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KIF4AO95239 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KIF4AO95239 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KIF4AO95239 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KIF4AO95239 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KIF4AO95239 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KIF4AO95239 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KIF4AO95239 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KIF4AO95239 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
KIF4AO95239 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KIF4AO95239 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KIF4AO95239 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KIF4AO95239 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KIF4AO95239 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KIF4AO95239 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
KIF4AO95239 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KIF4AO95239 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KIF4AO95239 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KIF4AO95239 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KIF4AO95239 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
KIF4AO95239 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
KIF4AO95239 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KIF4AO95239 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms