Protein–RNA interactions for Protein: O94876

TMCC1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC1O94876 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMCC1O94876 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMCC1O94876 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMCC1O94876 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMCC1O94876 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TMCC1O94876 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMCC1O94876 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMCC1O94876 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMCC1O94876 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMCC1O94876 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMCC1O94876 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TMCC1O94876 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMCC1O94876 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMCC1O94876 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMCC1O94876 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMCC1O94876 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMCC1O94876 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TMCC1O94876 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TMCC1O94876 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMCC1O94876 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMCC1O94876 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMCC1O94876 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMCC1O94876 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMCC1O94876 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMCC1O94876 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMCC1O94876 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMCC1O94876 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMCC1O94876 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMCC1O94876 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMCC1O94876 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMCC1O94876 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMCC1O94876 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMCC1O94876 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMCC1O94876 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMCC1O94876 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMCC1O94876 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMCC1O94876 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMCC1O94876 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMCC1O94876 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMCC1O94876 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMCC1O94876 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMCC1O94876 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMCC1O94876 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMCC1O94876 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMCC1O94876 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMCC1O94876 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TMCC1O94876 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMCC1O94876 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMCC1O94876 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMCC1O94876 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TMCC1O94876 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMCC1O94876 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMCC1O94876 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMCC1O94876 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMCC1O94876 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMCC1O94876 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMCC1O94876 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TMCC1O94876 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMCC1O94876 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMCC1O94876 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMCC1O94876 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMCC1O94876 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMCC1O94876 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMCC1O94876 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMCC1O94876 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMCC1O94876 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMCC1O94876 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMCC1O94876 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMCC1O94876 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMCC1O94876 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMCC1O94876 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMCC1O94876 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMCC1O94876 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMCC1O94876 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TMCC1O94876 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMCC1O94876 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMCC1O94876 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMCC1O94876 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMCC1O94876 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMCC1O94876 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMCC1O94876 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMCC1O94876 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMCC1O94876 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMCC1O94876 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TMCC1O94876 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TMCC1O94876 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMCC1O94876 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMCC1O94876 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMCC1O94876 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMCC1O94876 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMCC1O94876 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMCC1O94876 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMCC1O94876 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMCC1O94876 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMCC1O94876 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMCC1O94876 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TMCC1O94876 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMCC1O94876 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMCC1O94876 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMCC1O94876 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms