Protein–RNA interactions for Protein: O75808

CAPN15, Calpain-15, humanhuman

Predictions only

Length 1,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN15O75808 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CAPN15O75808 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CAPN15O75808 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CAPN15O75808 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CAPN15O75808 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CAPN15O75808 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CAPN15O75808 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CAPN15O75808 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CAPN15O75808 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CAPN15O75808 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAPN15O75808 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAPN15O75808 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAPN15O75808 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAPN15O75808 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAPN15O75808 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CAPN15O75808 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CAPN15O75808 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CAPN15O75808 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CAPN15O75808 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CAPN15O75808 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CAPN15O75808 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CAPN15O75808 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CAPN15O75808 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CAPN15O75808 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CAPN15O75808 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CAPN15O75808 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CAPN15O75808 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CAPN15O75808 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CAPN15O75808 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CAPN15O75808 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CAPN15O75808 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CAPN15O75808 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CAPN15O75808 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CAPN15O75808 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CAPN15O75808 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CAPN15O75808 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CAPN15O75808 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CAPN15O75808 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CAPN15O75808 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CAPN15O75808 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CAPN15O75808 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CAPN15O75808 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CAPN15O75808 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CAPN15O75808 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CAPN15O75808 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CAPN15O75808 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CAPN15O75808 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CAPN15O75808 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CAPN15O75808 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CAPN15O75808 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CAPN15O75808 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CAPN15O75808 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CAPN15O75808 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CAPN15O75808 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CAPN15O75808 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CAPN15O75808 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CAPN15O75808 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CAPN15O75808 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CAPN15O75808 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CAPN15O75808 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CAPN15O75808 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CAPN15O75808 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CAPN15O75808 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CAPN15O75808 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CAPN15O75808 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CAPN15O75808 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CAPN15O75808 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CAPN15O75808 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CAPN15O75808 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CAPN15O75808 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CAPN15O75808 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CAPN15O75808 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CAPN15O75808 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CAPN15O75808 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAPN15O75808 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAPN15O75808 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAPN15O75808 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAPN15O75808 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAPN15O75808 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAPN15O75808 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAPN15O75808 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAPN15O75808 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CAPN15O75808 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CAPN15O75808 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CAPN15O75808 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CAPN15O75808 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CAPN15O75808 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAPN15O75808 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAPN15O75808 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAPN15O75808 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAPN15O75808 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAPN15O75808 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAPN15O75808 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAPN15O75808 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAPN15O75808 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAPN15O75808 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAPN15O75808 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CAPN15O75808 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAPN15O75808 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CAPN15O75808 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms