Protein–RNA interactions for Protein: O75298

RTN2, Reticulon-2, humanhuman

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN2O75298 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RTN2O75298 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
RTN2O75298 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RTN2O75298 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RTN2O75298 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RTN2O75298 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RTN2O75298 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RTN2O75298 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RTN2O75298 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RTN2O75298 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTN2O75298 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTN2O75298 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTN2O75298 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTN2O75298 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTN2O75298 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTN2O75298 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RTN2O75298 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTN2O75298 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTN2O75298 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTN2O75298 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RTN2O75298 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTN2O75298 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTN2O75298 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTN2O75298 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTN2O75298 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTN2O75298 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTN2O75298 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTN2O75298 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTN2O75298 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RTN2O75298 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RTN2O75298 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RTN2O75298 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTN2O75298 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTN2O75298 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTN2O75298 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTN2O75298 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTN2O75298 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTN2O75298 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTN2O75298 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTN2O75298 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RTN2O75298 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RTN2O75298 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTN2O75298 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTN2O75298 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTN2O75298 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTN2O75298 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTN2O75298 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTN2O75298 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTN2O75298 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTN2O75298 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTN2O75298 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTN2O75298 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTN2O75298 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTN2O75298 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTN2O75298 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTN2O75298 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTN2O75298 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTN2O75298 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTN2O75298 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTN2O75298 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTN2O75298 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTN2O75298 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTN2O75298 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTN2O75298 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTN2O75298 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RTN2O75298 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTN2O75298 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTN2O75298 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RTN2O75298 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTN2O75298 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTN2O75298 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTN2O75298 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTN2O75298 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTN2O75298 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTN2O75298 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTN2O75298 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTN2O75298 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTN2O75298 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTN2O75298 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RTN2O75298 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RTN2O75298 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RTN2O75298 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RTN2O75298 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RTN2O75298 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RTN2O75298 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RTN2O75298 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RTN2O75298 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTN2O75298 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTN2O75298 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTN2O75298 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTN2O75298 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTN2O75298 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTN2O75298 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTN2O75298 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTN2O75298 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTN2O75298 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTN2O75298 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTN2O75298 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTN2O75298 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTN2O75298 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms