Protein–RNA interactions for Protein: O75074

LRP3, Low-density lipoprotein receptor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP3O75074 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LRP3O75074 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRP3O75074 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRP3O75074 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRP3O75074 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LRP3O75074 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRP3O75074 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRP3O75074 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRP3O75074 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRP3O75074 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LRP3O75074 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LRP3O75074 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRP3O75074 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRP3O75074 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRP3O75074 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRP3O75074 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRP3O75074 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRP3O75074 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRP3O75074 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRP3O75074 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LRP3O75074 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRP3O75074 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRP3O75074 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRP3O75074 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRP3O75074 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRP3O75074 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRP3O75074 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRP3O75074 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRP3O75074 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRP3O75074 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRP3O75074 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRP3O75074 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRP3O75074 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRP3O75074 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRP3O75074 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRP3O75074 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRP3O75074 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRP3O75074 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRP3O75074 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LRP3O75074 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRP3O75074 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRP3O75074 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRP3O75074 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRP3O75074 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRP3O75074 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRP3O75074 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRP3O75074 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LRP3O75074 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRP3O75074 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRP3O75074 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRP3O75074 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRP3O75074 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRP3O75074 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRP3O75074 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRP3O75074 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRP3O75074 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRP3O75074 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRP3O75074 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LRP3O75074 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRP3O75074 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRP3O75074 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LRP3O75074 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRP3O75074 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRP3O75074 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRP3O75074 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRP3O75074 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRP3O75074 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRP3O75074 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRP3O75074 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LRP3O75074 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRP3O75074 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRP3O75074 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRP3O75074 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRP3O75074 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRP3O75074 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRP3O75074 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRP3O75074 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRP3O75074 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRP3O75074 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRP3O75074 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRP3O75074 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRP3O75074 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRP3O75074 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRP3O75074 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRP3O75074 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRP3O75074 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRP3O75074 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRP3O75074 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRP3O75074 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRP3O75074 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRP3O75074 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
LRP3O75074 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRP3O75074 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRP3O75074 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRP3O75074 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRP3O75074 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRP3O75074 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRP3O75074 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRP3O75074 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRP3O75074 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms