Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
GRIN3BO60391 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GRIN3BO60391 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GRIN3BO60391 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GRIN3BO60391 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GRIN3BO60391 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GRIN3BO60391 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GRIN3BO60391 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
GRIN3BO60391 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GRIN3BO60391 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GRIN3BO60391 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GRIN3BO60391 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GRIN3BO60391 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GRIN3BO60391 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
GRIN3BO60391 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GRIN3BO60391 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GRIN3BO60391 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GRIN3BO60391 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
GRIN3BO60391 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GRIN3BO60391 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GRIN3BO60391 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
GRIN3BO60391 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GRIN3BO60391 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
GRIN3BO60391 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GRIN3BO60391 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GRIN3BO60391 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GRIN3BO60391 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GRIN3BO60391 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GRIN3BO60391 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GRIN3BO60391 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GRIN3BO60391 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GRIN3BO60391 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GRIN3BO60391 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GRIN3BO60391 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GRIN3BO60391 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
GRIN3BO60391 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GRIN3BO60391 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GRIN3BO60391 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GRIN3BO60391 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GRIN3BO60391 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GRIN3BO60391 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GRIN3BO60391 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GRIN3BO60391 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GRIN3BO60391 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
GRIN3BO60391 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GRIN3BO60391 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GRIN3BO60391 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GRIN3BO60391 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GRIN3BO60391 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GRIN3BO60391 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GRIN3BO60391 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GRIN3BO60391 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GRIN3BO60391 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GRIN3BO60391 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
GRIN3BO60391 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GRIN3BO60391 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GRIN3BO60391 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GRIN3BO60391 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GRIN3BO60391 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GRIN3BO60391 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GRIN3BO60391 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GRIN3BO60391 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GRIN3BO60391 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GRIN3BO60391 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GRIN3BO60391 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GRIN3BO60391 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GRIN3BO60391 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GRIN3BO60391 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GRIN3BO60391 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GRIN3BO60391 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GRIN3BO60391 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GRIN3BO60391 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GRIN3BO60391 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GRIN3BO60391 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GRIN3BO60391 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GRIN3BO60391 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GRIN3BO60391 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GRIN3BO60391 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GRIN3BO60391 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
GRIN3BO60391 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GRIN3BO60391 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GRIN3BO60391 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GRIN3BO60391 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GRIN3BO60391 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
GRIN3BO60391 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GRIN3BO60391 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GRIN3BO60391 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GRIN3BO60391 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GRIN3BO60391 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GRIN3BO60391 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GRIN3BO60391 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GRIN3BO60391 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GRIN3BO60391 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GRIN3BO60391 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GRIN3BO60391 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GRIN3BO60391 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
GRIN3BO60391 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GRIN3BO60391 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GRIN3BO60391 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GRIN3BO60391 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms