Protein–RNA interactions for Protein: O60291

MGRN1, E3 ubiquitin-protein ligase MGRN1, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGRN1O60291 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MGRN1O60291 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MGRN1O60291 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MGRN1O60291 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MGRN1O60291 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MGRN1O60291 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MGRN1O60291 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MGRN1O60291 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MGRN1O60291 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MGRN1O60291 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MGRN1O60291 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MGRN1O60291 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MGRN1O60291 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MGRN1O60291 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MGRN1O60291 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MGRN1O60291 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MGRN1O60291 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MGRN1O60291 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MGRN1O60291 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MGRN1O60291 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MGRN1O60291 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MGRN1O60291 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MGRN1O60291 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MGRN1O60291 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MGRN1O60291 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MGRN1O60291 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MGRN1O60291 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MGRN1O60291 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MGRN1O60291 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MGRN1O60291 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MGRN1O60291 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MGRN1O60291 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MGRN1O60291 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MGRN1O60291 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MGRN1O60291 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MGRN1O60291 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MGRN1O60291 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MGRN1O60291 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MGRN1O60291 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MGRN1O60291 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MGRN1O60291 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MGRN1O60291 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MGRN1O60291 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MGRN1O60291 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MGRN1O60291 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MGRN1O60291 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MGRN1O60291 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MGRN1O60291 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MGRN1O60291 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MGRN1O60291 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MGRN1O60291 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MGRN1O60291 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MGRN1O60291 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MGRN1O60291 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MGRN1O60291 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MGRN1O60291 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MGRN1O60291 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MGRN1O60291 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MGRN1O60291 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MGRN1O60291 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MGRN1O60291 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MGRN1O60291 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MGRN1O60291 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MGRN1O60291 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MGRN1O60291 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MGRN1O60291 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MGRN1O60291 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MGRN1O60291 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MGRN1O60291 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MGRN1O60291 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MGRN1O60291 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MGRN1O60291 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MGRN1O60291 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MGRN1O60291 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MGRN1O60291 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MGRN1O60291 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MGRN1O60291 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MGRN1O60291 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MGRN1O60291 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MGRN1O60291 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MGRN1O60291 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MGRN1O60291 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MGRN1O60291 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MGRN1O60291 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MGRN1O60291 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MGRN1O60291 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MGRN1O60291 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MGRN1O60291 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MGRN1O60291 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MGRN1O60291 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MGRN1O60291 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MGRN1O60291 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MGRN1O60291 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MGRN1O60291 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MGRN1O60291 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MGRN1O60291 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MGRN1O60291 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MGRN1O60291 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MGRN1O60291 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MGRN1O60291 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms