Protein–RNA interactions for Protein: O43791

SPOP, Speckle-type POZ protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOPO43791 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPOPO43791 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPOPO43791 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPOPO43791 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPOPO43791 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPOPO43791 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPOPO43791 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPOPO43791 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPOPO43791 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SPOPO43791 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPOPO43791 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPOPO43791 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPOPO43791 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPOPO43791 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPOPO43791 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPOPO43791 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPOPO43791 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPOPO43791 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SPOPO43791 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPOPO43791 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPOPO43791 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPOPO43791 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPOPO43791 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPOPO43791 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPOPO43791 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPOPO43791 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPOPO43791 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPOPO43791 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPOPO43791 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPOPO43791 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPOPO43791 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPOPO43791 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPOPO43791 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPOPO43791 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPOPO43791 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPOPO43791 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPOPO43791 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPOPO43791 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPOPO43791 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPOPO43791 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPOPO43791 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPOPO43791 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPOPO43791 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPOPO43791 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPOPO43791 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPOPO43791 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPOPO43791 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPOPO43791 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPOPO43791 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPOPO43791 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPOPO43791 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPOPO43791 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SPOPO43791 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPOPO43791 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPOPO43791 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPOPO43791 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPOPO43791 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPOPO43791 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPOPO43791 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPOPO43791 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPOPO43791 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPOPO43791 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPOPO43791 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPOPO43791 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPOPO43791 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPOPO43791 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SPOPO43791 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPOPO43791 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPOPO43791 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPOPO43791 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPOPO43791 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPOPO43791 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPOPO43791 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPOPO43791 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPOPO43791 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SPOPO43791 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPOPO43791 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPOPO43791 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPOPO43791 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPOPO43791 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPOPO43791 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPOPO43791 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPOPO43791 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPOPO43791 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPOPO43791 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SPOPO43791 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPOPO43791 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPOPO43791 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SPOPO43791 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPOPO43791 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPOPO43791 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPOPO43791 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPOPO43791 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPOPO43791 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SPOPO43791 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPOPO43791 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPOPO43791 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPOPO43791 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPOPO43791 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPOPO43791 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms