Protein–RNA interactions for Protein: O43502

RAD51C, DNA repair protein RAD51 homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51CO43502 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD51CO43502 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD51CO43502 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD51CO43502 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD51CO43502 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD51CO43502 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD51CO43502 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD51CO43502 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD51CO43502 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD51CO43502 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD51CO43502 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAD51CO43502 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RAD51CO43502 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAD51CO43502 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RAD51CO43502 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD51CO43502 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD51CO43502 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD51CO43502 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD51CO43502 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD51CO43502 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD51CO43502 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD51CO43502 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD51CO43502 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD51CO43502 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD51CO43502 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD51CO43502 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD51CO43502 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD51CO43502 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD51CO43502 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD51CO43502 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD51CO43502 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD51CO43502 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD51CO43502 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD51CO43502 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD51CO43502 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD51CO43502 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD51CO43502 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD51CO43502 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD51CO43502 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD51CO43502 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD51CO43502 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD51CO43502 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD51CO43502 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD51CO43502 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD51CO43502 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD51CO43502 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAD51CO43502 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAD51CO43502 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAD51CO43502 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAD51CO43502 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAD51CO43502 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAD51CO43502 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAD51CO43502 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD51CO43502 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD51CO43502 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD51CO43502 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD51CO43502 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD51CO43502 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD51CO43502 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD51CO43502 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD51CO43502 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD51CO43502 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD51CO43502 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD51CO43502 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD51CO43502 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD51CO43502 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD51CO43502 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD51CO43502 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD51CO43502 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD51CO43502 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAD51CO43502 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAD51CO43502 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAD51CO43502 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAD51CO43502 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAD51CO43502 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAD51CO43502 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAD51CO43502 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAD51CO43502 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD51CO43502 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD51CO43502 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD51CO43502 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD51CO43502 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD51CO43502 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD51CO43502 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD51CO43502 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAD51CO43502 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAD51CO43502 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAD51CO43502 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAD51CO43502 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAD51CO43502 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAD51CO43502 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD51CO43502 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD51CO43502 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD51CO43502 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD51CO43502 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD51CO43502 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD51CO43502 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD51CO43502 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD51CO43502 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAD51CO43502 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms