Protein–RNA interactions for Protein: O43164

PJA2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PJA2O43164 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PJA2O43164 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PJA2O43164 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PJA2O43164 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PJA2O43164 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PJA2O43164 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PJA2O43164 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PJA2O43164 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PJA2O43164 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PJA2O43164 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PJA2O43164 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PJA2O43164 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PJA2O43164 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PJA2O43164 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PJA2O43164 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PJA2O43164 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PJA2O43164 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PJA2O43164 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PJA2O43164 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PJA2O43164 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PJA2O43164 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PJA2O43164 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PJA2O43164 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PJA2O43164 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PJA2O43164 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PJA2O43164 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PJA2O43164 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PJA2O43164 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PJA2O43164 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PJA2O43164 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PJA2O43164 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PJA2O43164 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PJA2O43164 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PJA2O43164 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PJA2O43164 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PJA2O43164 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PJA2O43164 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PJA2O43164 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PJA2O43164 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PJA2O43164 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PJA2O43164 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PJA2O43164 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PJA2O43164 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PJA2O43164 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PJA2O43164 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PJA2O43164 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PJA2O43164 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PJA2O43164 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PJA2O43164 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PJA2O43164 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PJA2O43164 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PJA2O43164 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PJA2O43164 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PJA2O43164 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PJA2O43164 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PJA2O43164 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PJA2O43164 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PJA2O43164 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PJA2O43164 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PJA2O43164 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PJA2O43164 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PJA2O43164 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PJA2O43164 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PJA2O43164 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PJA2O43164 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PJA2O43164 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PJA2O43164 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PJA2O43164 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PJA2O43164 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PJA2O43164 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PJA2O43164 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PJA2O43164 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PJA2O43164 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PJA2O43164 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PJA2O43164 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PJA2O43164 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PJA2O43164 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PJA2O43164 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PJA2O43164 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PJA2O43164 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PJA2O43164 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PJA2O43164 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PJA2O43164 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PJA2O43164 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PJA2O43164 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PJA2O43164 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PJA2O43164 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PJA2O43164 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PJA2O43164 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PJA2O43164 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PJA2O43164 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PJA2O43164 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PJA2O43164 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PJA2O43164 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PJA2O43164 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PJA2O43164 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PJA2O43164 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PJA2O43164 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PJA2O43164 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PJA2O43164 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms