Protein–RNA interactions for Protein: O14544

SOCS6, Suppressor of cytokine signaling 6, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS6O14544 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOCS6O14544 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOCS6O14544 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOCS6O14544 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOCS6O14544 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOCS6O14544 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOCS6O14544 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOCS6O14544 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOCS6O14544 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOCS6O14544 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SOCS6O14544 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOCS6O14544 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SOCS6O14544 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOCS6O14544 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOCS6O14544 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SOCS6O14544 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOCS6O14544 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOCS6O14544 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOCS6O14544 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOCS6O14544 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SOCS6O14544 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SOCS6O14544 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOCS6O14544 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOCS6O14544 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOCS6O14544 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOCS6O14544 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOCS6O14544 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOCS6O14544 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOCS6O14544 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOCS6O14544 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOCS6O14544 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOCS6O14544 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOCS6O14544 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOCS6O14544 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SOCS6O14544 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOCS6O14544 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOCS6O14544 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOCS6O14544 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOCS6O14544 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOCS6O14544 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOCS6O14544 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOCS6O14544 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOCS6O14544 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOCS6O14544 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOCS6O14544 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOCS6O14544 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOCS6O14544 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOCS6O14544 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOCS6O14544 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOCS6O14544 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOCS6O14544 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOCS6O14544 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOCS6O14544 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOCS6O14544 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOCS6O14544 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SOCS6O14544 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOCS6O14544 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOCS6O14544 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOCS6O14544 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOCS6O14544 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOCS6O14544 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOCS6O14544 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOCS6O14544 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOCS6O14544 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOCS6O14544 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOCS6O14544 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOCS6O14544 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOCS6O14544 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SOCS6O14544 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SOCS6O14544 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SOCS6O14544 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SOCS6O14544 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SOCS6O14544 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOCS6O14544 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOCS6O14544 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOCS6O14544 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOCS6O14544 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOCS6O14544 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOCS6O14544 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SOCS6O14544 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOCS6O14544 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOCS6O14544 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOCS6O14544 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOCS6O14544 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOCS6O14544 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOCS6O14544 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOCS6O14544 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOCS6O14544 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOCS6O14544 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOCS6O14544 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOCS6O14544 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOCS6O14544 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SOCS6O14544 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOCS6O14544 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOCS6O14544 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOCS6O14544 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOCS6O14544 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SOCS6O14544 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOCS6O14544 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOCS6O14544 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms