Protein–RNA interactions for Protein: O00220

TNFRSF10A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10A, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF10AO00220 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNFRSF10AO00220 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TNFRSF10AO00220 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFRSF10AO00220 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFRSF10AO00220 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFRSF10AO00220 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFRSF10AO00220 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFRSF10AO00220 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFRSF10AO00220 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFRSF10AO00220 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFRSF10AO00220 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFRSF10AO00220 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFRSF10AO00220 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFRSF10AO00220 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFRSF10AO00220 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFRSF10AO00220 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFRSF10AO00220 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFRSF10AO00220 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFRSF10AO00220 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TNFRSF10AO00220 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TNFRSF10AO00220 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNFRSF10AO00220 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNFRSF10AO00220 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNFRSF10AO00220 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNFRSF10AO00220 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNFRSF10AO00220 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNFRSF10AO00220 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNFRSF10AO00220 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFRSF10AO00220 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFRSF10AO00220 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFRSF10AO00220 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFRSF10AO00220 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFRSF10AO00220 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFRSF10AO00220 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFRSF10AO00220 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFRSF10AO00220 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFRSF10AO00220 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFRSF10AO00220 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFRSF10AO00220 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFRSF10AO00220 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFRSF10AO00220 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFRSF10AO00220 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFRSF10AO00220 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFRSF10AO00220 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFRSF10AO00220 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFRSF10AO00220 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFRSF10AO00220 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFRSF10AO00220 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFRSF10AO00220 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFRSF10AO00220 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF10AO00220 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF10AO00220 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF10AO00220 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF10AO00220 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF10AO00220 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF10AO00220 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF10AO00220 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF10AO00220 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF10AO00220 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF10AO00220 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF10AO00220 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF10AO00220 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF10AO00220 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF10AO00220 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF10AO00220 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF10AO00220 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF10AO00220 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFRSF10AO00220 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFRSF10AO00220 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFRSF10AO00220 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFRSF10AO00220 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFRSF10AO00220 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFRSF10AO00220 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFRSF10AO00220 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFRSF10AO00220 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNFRSF10AO00220 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNFRSF10AO00220 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFRSF10AO00220 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFRSF10AO00220 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFRSF10AO00220 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFRSF10AO00220 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFRSF10AO00220 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFRSF10AO00220 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFRSF10AO00220 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFRSF10AO00220 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFRSF10AO00220 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFRSF10AO00220 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFRSF10AO00220 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFRSF10AO00220 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFRSF10AO00220 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFRSF10AO00220 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFRSF10AO00220 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFRSF10AO00220 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFRSF10AO00220 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFRSF10AO00220 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFRSF10AO00220 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFRSF10AO00220 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFRSF10AO00220 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFRSF10AO00220 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFRSF10AO00220 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms