Protein–RNA interactions for Protein: J3QR89

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QR89 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
J3QR89 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
J3QR89 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
J3QR89 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
J3QR89 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
J3QR89 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
J3QR89 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
J3QR89 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
J3QR89 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
J3QR89 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
J3QR89 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
J3QR89 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
J3QR89 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
J3QR89 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
J3QR89 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
J3QR89 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QR89 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QR89 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QR89 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QR89 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QR89 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QR89 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QR89 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QR89 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QR89 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QR89 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QR89 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QR89 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QR89 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QR89 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QR89 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QR89 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QR89 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QR89 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QR89 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QR89 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QR89 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QR89 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QR89 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QR89 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QR89 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QR89 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QR89 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QR89 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QR89 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QR89 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QR89 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QR89 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QR89 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QR89 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QR89 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QR89 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QR89 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
J3QR89 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
J3QR89 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
J3QR89 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
J3QR89 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QR89 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QR89 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QR89 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QR89 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QR89 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QR89 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QR89 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QR89 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QR89 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QR89 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QR89 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QR89 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QR89 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QR89 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QR89 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3QR89 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3QR89 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3QR89 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3QR89 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3QR89 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3QR89 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3QR89 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3QR89 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3QR89 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3QR89 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3QR89 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3QR89 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3QR89 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3QR89 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3QR89 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3QR89 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3QR89 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3QR89 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QR89 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QR89 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QR89 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QR89 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QR89 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QR89 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QR89 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QR89 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QR89 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QR89 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms