Protein–RNA interactions for Protein: J3QKU1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QKU1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
J3QKU1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
J3QKU1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
J3QKU1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
J3QKU1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
J3QKU1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
J3QKU1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
J3QKU1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
J3QKU1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
J3QKU1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
J3QKU1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
J3QKU1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
J3QKU1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
J3QKU1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
J3QKU1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
J3QKU1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
J3QKU1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
J3QKU1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
J3QKU1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
J3QKU1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
J3QKU1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
J3QKU1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
J3QKU1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
J3QKU1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
J3QKU1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
J3QKU1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
J3QKU1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
J3QKU1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
J3QKU1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
J3QKU1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
J3QKU1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
J3QKU1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
J3QKU1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
J3QKU1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
J3QKU1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
J3QKU1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
J3QKU1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
J3QKU1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
J3QKU1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
J3QKU1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
J3QKU1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
J3QKU1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
J3QKU1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
J3QKU1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
J3QKU1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
J3QKU1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
J3QKU1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
J3QKU1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
J3QKU1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
J3QKU1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
J3QKU1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
J3QKU1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
J3QKU1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
J3QKU1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
J3QKU1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
J3QKU1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
J3QKU1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
J3QKU1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
J3QKU1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
J3QKU1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
J3QKU1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
J3QKU1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
J3QKU1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
J3QKU1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
J3QKU1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
J3QKU1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
J3QKU1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
J3QKU1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
J3QKU1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
J3QKU1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
J3QKU1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
J3QKU1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
J3QKU1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
J3QKU1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
J3QKU1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
J3QKU1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
J3QKU1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
J3QKU1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
J3QKU1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
J3QKU1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
J3QKU1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
J3QKU1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
J3QKU1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
J3QKU1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
J3QKU1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
J3QKU1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
J3QKU1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
J3QKU1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
J3QKU1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
J3QKU1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
J3QKU1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
J3QKU1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
J3QKU1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
J3QKU1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
J3QKU1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
J3QKU1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
J3QKU1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
J3QKU1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
J3QKU1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
J3QKU1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms