Protein–RNA interactions for Protein: H3BML4

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BML4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
H3BML4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
H3BML4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H3BML4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H3BML4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H3BML4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
H3BML4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H3BML4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H3BML4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H3BML4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H3BML4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H3BML4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
H3BML4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.31■■□□□ 1
H3BML4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
H3BML4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.31■■□□□ 1
H3BML4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H3BML4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H3BML4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H3BML4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H3BML4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
H3BML4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
H3BML4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
H3BML4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
H3BML4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
H3BML4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H3BML4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
H3BML4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H3BML4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H3BML4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
H3BML4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.29■■□□□ 1
H3BML4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
H3BML4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
H3BML4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H3BML4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
H3BML4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H3BML4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
H3BML4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H3BML4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H3BML4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
H3BML4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
H3BML4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H3BML4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H3BML4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H3BML4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H3BML4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H3BML4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
H3BML4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
H3BML4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H3BML4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
H3BML4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H3BML4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H3BML4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H3BML4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
H3BML4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
H3BML4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
H3BML4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H3BML4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H3BML4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H3BML4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H3BML4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H3BML4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H3BML4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H3BML4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H3BML4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H3BML4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
H3BML4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H3BML4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H3BML4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H3BML4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H3BML4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
H3BML4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H3BML4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H3BML4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H3BML4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
H3BML4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H3BML4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H3BML4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H3BML4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
H3BML4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H3BML4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
H3BML4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H3BML4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H3BML4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H3BML4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H3BML4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H3BML4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H3BML4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
H3BML4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H3BML4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
H3BML4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
H3BML4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H3BML4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H3BML4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
H3BML4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
H3BML4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H3BML4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H3BML4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H3BML4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H3BML4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
H3BML4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms