Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTLL13PA6NNM8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTLL13PA6NNM8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TTLL13PA6NNM8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTLL13PA6NNM8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTLL13PA6NNM8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTLL13PA6NNM8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTLL13PA6NNM8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTLL13PA6NNM8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTLL13PA6NNM8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTLL13PA6NNM8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTLL13PA6NNM8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTLL13PA6NNM8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTLL13PA6NNM8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTLL13PA6NNM8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTLL13PA6NNM8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTLL13PA6NNM8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTLL13PA6NNM8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTLL13PA6NNM8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTLL13PA6NNM8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTLL13PA6NNM8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTLL13PA6NNM8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTLL13PA6NNM8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTLL13PA6NNM8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTLL13PA6NNM8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTLL13PA6NNM8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTLL13PA6NNM8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTLL13PA6NNM8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTLL13PA6NNM8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TTLL13PA6NNM8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TTLL13PA6NNM8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTLL13PA6NNM8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTLL13PA6NNM8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTLL13PA6NNM8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTLL13PA6NNM8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTLL13PA6NNM8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTLL13PA6NNM8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTLL13PA6NNM8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTLL13PA6NNM8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TTLL13PA6NNM8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TTLL13PA6NNM8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTLL13PA6NNM8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTLL13PA6NNM8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTLL13PA6NNM8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTLL13PA6NNM8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TTLL13PA6NNM8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTLL13PA6NNM8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTLL13PA6NNM8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTLL13PA6NNM8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTLL13PA6NNM8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTLL13PA6NNM8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTLL13PA6NNM8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTLL13PA6NNM8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTLL13PA6NNM8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTLL13PA6NNM8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTLL13PA6NNM8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTLL13PA6NNM8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTLL13PA6NNM8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTLL13PA6NNM8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTLL13PA6NNM8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTLL13PA6NNM8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTLL13PA6NNM8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TTLL13PA6NNM8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTLL13PA6NNM8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTLL13PA6NNM8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTLL13PA6NNM8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTLL13PA6NNM8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTLL13PA6NNM8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTLL13PA6NNM8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TTLL13PA6NNM8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TTLL13PA6NNM8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TTLL13PA6NNM8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TTLL13PA6NNM8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TTLL13PA6NNM8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TTLL13PA6NNM8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TTLL13PA6NNM8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TTLL13PA6NNM8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TTLL13PA6NNM8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TTLL13PA6NNM8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TTLL13PA6NNM8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TTLL13PA6NNM8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TTLL13PA6NNM8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TTLL13PA6NNM8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTLL13PA6NNM8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTLL13PA6NNM8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTLL13PA6NNM8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTLL13PA6NNM8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTLL13PA6NNM8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTLL13PA6NNM8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTLL13PA6NNM8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTLL13PA6NNM8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTLL13PA6NNM8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTLL13PA6NNM8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTLL13PA6NNM8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTLL13PA6NNM8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTLL13PA6NNM8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTLL13PA6NNM8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTLL13PA6NNM8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTLL13PA6NNM8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTLL13PA6NNM8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms