Protein–RNA interactions for Protein: A6NLX3

SPDYE4, Speedy protein E4, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYE4A6NLX3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPDYE4A6NLX3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPDYE4A6NLX3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPDYE4A6NLX3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPDYE4A6NLX3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPDYE4A6NLX3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPDYE4A6NLX3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPDYE4A6NLX3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPDYE4A6NLX3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPDYE4A6NLX3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPDYE4A6NLX3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPDYE4A6NLX3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPDYE4A6NLX3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPDYE4A6NLX3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPDYE4A6NLX3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPDYE4A6NLX3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPDYE4A6NLX3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPDYE4A6NLX3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPDYE4A6NLX3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPDYE4A6NLX3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPDYE4A6NLX3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPDYE4A6NLX3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPDYE4A6NLX3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPDYE4A6NLX3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPDYE4A6NLX3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPDYE4A6NLX3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPDYE4A6NLX3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPDYE4A6NLX3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPDYE4A6NLX3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPDYE4A6NLX3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SPDYE4A6NLX3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPDYE4A6NLX3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPDYE4A6NLX3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPDYE4A6NLX3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPDYE4A6NLX3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPDYE4A6NLX3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPDYE4A6NLX3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPDYE4A6NLX3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPDYE4A6NLX3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPDYE4A6NLX3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPDYE4A6NLX3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPDYE4A6NLX3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPDYE4A6NLX3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPDYE4A6NLX3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SPDYE4A6NLX3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPDYE4A6NLX3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPDYE4A6NLX3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPDYE4A6NLX3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SPDYE4A6NLX3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPDYE4A6NLX3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SPDYE4A6NLX3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPDYE4A6NLX3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPDYE4A6NLX3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPDYE4A6NLX3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPDYE4A6NLX3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPDYE4A6NLX3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPDYE4A6NLX3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPDYE4A6NLX3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPDYE4A6NLX3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPDYE4A6NLX3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPDYE4A6NLX3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPDYE4A6NLX3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPDYE4A6NLX3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPDYE4A6NLX3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SPDYE4A6NLX3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPDYE4A6NLX3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPDYE4A6NLX3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPDYE4A6NLX3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPDYE4A6NLX3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPDYE4A6NLX3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SPDYE4A6NLX3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPDYE4A6NLX3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPDYE4A6NLX3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPDYE4A6NLX3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPDYE4A6NLX3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPDYE4A6NLX3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPDYE4A6NLX3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPDYE4A6NLX3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPDYE4A6NLX3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPDYE4A6NLX3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPDYE4A6NLX3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPDYE4A6NLX3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPDYE4A6NLX3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPDYE4A6NLX3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SPDYE4A6NLX3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPDYE4A6NLX3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPDYE4A6NLX3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPDYE4A6NLX3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPDYE4A6NLX3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPDYE4A6NLX3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPDYE4A6NLX3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPDYE4A6NLX3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPDYE4A6NLX3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPDYE4A6NLX3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPDYE4A6NLX3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPDYE4A6NLX3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPDYE4A6NLX3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPDYE4A6NLX3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SPDYE4A6NLX3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SPDYE4A6NLX3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms