Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEMP2A6NFY4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEMP2A6NFY4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEMP2A6NFY4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NEMP2A6NFY4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEMP2A6NFY4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEMP2A6NFY4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEMP2A6NFY4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEMP2A6NFY4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEMP2A6NFY4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEMP2A6NFY4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEMP2A6NFY4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEMP2A6NFY4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEMP2A6NFY4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NEMP2A6NFY4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NEMP2A6NFY4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEMP2A6NFY4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NEMP2A6NFY4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEMP2A6NFY4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEMP2A6NFY4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEMP2A6NFY4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NEMP2A6NFY4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEMP2A6NFY4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEMP2A6NFY4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEMP2A6NFY4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEMP2A6NFY4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEMP2A6NFY4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEMP2A6NFY4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEMP2A6NFY4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEMP2A6NFY4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEMP2A6NFY4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEMP2A6NFY4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEMP2A6NFY4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEMP2A6NFY4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEMP2A6NFY4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEMP2A6NFY4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEMP2A6NFY4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEMP2A6NFY4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEMP2A6NFY4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NEMP2A6NFY4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEMP2A6NFY4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEMP2A6NFY4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEMP2A6NFY4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEMP2A6NFY4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEMP2A6NFY4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEMP2A6NFY4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEMP2A6NFY4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NEMP2A6NFY4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEMP2A6NFY4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEMP2A6NFY4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEMP2A6NFY4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEMP2A6NFY4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NEMP2A6NFY4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEMP2A6NFY4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEMP2A6NFY4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEMP2A6NFY4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEMP2A6NFY4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEMP2A6NFY4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NEMP2A6NFY4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEMP2A6NFY4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEMP2A6NFY4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEMP2A6NFY4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEMP2A6NFY4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEMP2A6NFY4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEMP2A6NFY4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEMP2A6NFY4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEMP2A6NFY4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEMP2A6NFY4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEMP2A6NFY4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEMP2A6NFY4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEMP2A6NFY4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEMP2A6NFY4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEMP2A6NFY4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEMP2A6NFY4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEMP2A6NFY4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEMP2A6NFY4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEMP2A6NFY4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEMP2A6NFY4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEMP2A6NFY4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEMP2A6NFY4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NEMP2A6NFY4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEMP2A6NFY4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEMP2A6NFY4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NEMP2A6NFY4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEMP2A6NFY4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEMP2A6NFY4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEMP2A6NFY4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEMP2A6NFY4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEMP2A6NFY4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEMP2A6NFY4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEMP2A6NFY4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEMP2A6NFY4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEMP2A6NFY4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEMP2A6NFY4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEMP2A6NFY4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NEMP2A6NFY4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEMP2A6NFY4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEMP2A6NFY4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEMP2A6NFY4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEMP2A6NFY4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms