Protein–RNA interactions for Protein: A2VEC9

SSPO, SCO-spondin, humanhuman

Predictions only

Length 5,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPOA2VEC9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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