Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUW1

BRK1, Protein BRICK1, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRK1Q8WUW1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRK1Q8WUW1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
BRK1Q8WUW1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BRK1Q8WUW1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BRK1Q8WUW1 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BRK1Q8WUW1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BRK1Q8WUW1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BRK1Q8WUW1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BRK1Q8WUW1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BRK1Q8WUW1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BRK1Q8WUW1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BRK1Q8WUW1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BRK1Q8WUW1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRK1Q8WUW1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRK1Q8WUW1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRK1Q8WUW1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BRK1Q8WUW1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BRK1Q8WUW1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
BRK1Q8WUW1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRK1Q8WUW1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BRK1Q8WUW1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRK1Q8WUW1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRK1Q8WUW1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRK1Q8WUW1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRK1Q8WUW1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRK1Q8WUW1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRK1Q8WUW1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRK1Q8WUW1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRK1Q8WUW1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRK1Q8WUW1 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRK1Q8WUW1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BRK1Q8WUW1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRK1Q8WUW1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRK1Q8WUW1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRK1Q8WUW1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BRK1Q8WUW1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRK1Q8WUW1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRK1Q8WUW1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BRK1Q8WUW1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRK1Q8WUW1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRK1Q8WUW1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRK1Q8WUW1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRK1Q8WUW1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRK1Q8WUW1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRK1Q8WUW1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRK1Q8WUW1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRK1Q8WUW1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRK1Q8WUW1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRK1Q8WUW1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRK1Q8WUW1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRK1Q8WUW1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRK1Q8WUW1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRK1Q8WUW1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRK1Q8WUW1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRK1Q8WUW1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRK1Q8WUW1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRK1Q8WUW1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRK1Q8WUW1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRK1Q8WUW1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRK1Q8WUW1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BRK1Q8WUW1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BRK1Q8WUW1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRK1Q8WUW1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRK1Q8WUW1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRK1Q8WUW1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRK1Q8WUW1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRK1Q8WUW1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRK1Q8WUW1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRK1Q8WUW1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRK1Q8WUW1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRK1Q8WUW1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BRK1Q8WUW1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BRK1Q8WUW1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BRK1Q8WUW1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BRK1Q8WUW1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BRK1Q8WUW1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRK1Q8WUW1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRK1Q8WUW1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRK1Q8WUW1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRK1Q8WUW1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BRK1Q8WUW1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BRK1Q8WUW1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BRK1Q8WUW1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BRK1Q8WUW1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRK1Q8WUW1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRK1Q8WUW1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRK1Q8WUW1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRK1Q8WUW1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRK1Q8WUW1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRK1Q8WUW1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRK1Q8WUW1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRK1Q8WUW1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRK1Q8WUW1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRK1Q8WUW1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
BRK1Q8WUW1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
BRK1Q8WUW1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRK1Q8WUW1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRK1Q8WUW1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRK1Q8WUW1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRK1Q8WUW1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms