Protein–RNA interactions for Protein: Q12874

SF3A3, Splicing factor 3A subunit 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A3Q12874 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC2.88□□□□□ -1.951e-15■■■■■ 121.6
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SF3A3Q12874 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.443e-17■■■■■ 113.7
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SF3A3Q12874 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.46e-28■■■■■ 103.8
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SF3A3Q12874 PIN1-209ENST00000590540 702 ntTSL 311.47□□□□□ -0.572e-6■■■■■ 89.3
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SF3A3Q12874 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.582e-13■■■■■ 89
SF3A3Q12874 MELTF-203ENST00000439320 629 ntTSL 315.46■□□□□ 0.072e-13■■■■■ 89
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SF3A3Q12874 RNF166-204ENST00000562499 590 ntTSL 49.2□□□□□ -0.942e-13■■■■■ 89
SF3A3Q12874 AP1M1-204ENST00000586461 545 ntTSL 38.38□□□□□ -1.072e-13■■■■■ 89
SF3A3Q12874 AP1M1-207ENST00000589782 436 ntTSL 57.55□□□□□ -1.22e-13■■■■■ 89
SF3A3Q12874 AP000311.1-201ENST00000429238 1078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.222e-13■■■■■ 89
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SF3A3Q12874 INTS11-230ENST00000526332 579 ntTSL 417.14■□□□□ 0.333e-15■■■■■ 85.6
SF3A3Q12874 INTS11-218ENST00000488042 1134 ntTSL 216.4■□□□□ 0.223e-15■■■■■ 85.6
SF3A3Q12874 INTS11-237ENST00000530031 800 ntTSL 516.27■□□□□ 0.23e-15■■■■■ 85.6
SF3A3Q12874 INTS11-232ENST00000526904 551 ntTSL 414.77□□□□□ -0.053e-15■■■■■ 85.6
SF3A3Q12874 INTS11-229ENST00000526113 591 ntTSL 512.66□□□□□ -0.383e-15■■■■■ 85.6
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