Protein–RNA interactions for Protein: Q12211

PUS1, tRNA pseudouridine synthase 1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 544 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUS1Q12211 ALF1YNL148C 765 nt13.26□□□□□ -0.29
PUS1Q12211 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.23□□□□□ -0.29
PUS1Q12211 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.23□□□□□ -0.29
PUS1Q12211 YPS1YLR120C 1710 nt13.19□□□□□ -0.3
PUS1Q12211 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt13.19□□□□□ -0.3
PUS1Q12211 YDR095CYDR095C 411 nt13.18□□□□□ -0.3
PUS1Q12211 DSK2YMR276W 1122 nt13.12□□□□□ -0.31
PUS1Q12211 MOT3YMR070W 1473 nt13.11□□□□□ -0.31
PUS1Q12211 IMP2'YIL154C 1041 nt13.09□□□□□ -0.31
PUS1Q12211 DCW1YKL046C 1350 nt13.07□□□□□ -0.32
PUS1Q12211 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.07□□□□□ -0.32
PUS1Q12211 YLR236CYLR236C 324 nt13.07□□□□□ -0.32
PUS1Q12211 FMP45YDL222C 930 nt13.06□□□□□ -0.32
PUS1Q12211 YPR011CYPR011C 981 nt13.04□□□□□ -0.32
PUS1Q12211 YBR220CYBR220C 1683 nt13.02□□□□□ -0.32
PUS1Q12211 YJL152WYJL152W 360 nt13.02□□□□□ -0.33
PUS1Q12211 SIS1YNL007C 1059 nt13.02□□□□□ -0.33
PUS1Q12211 YCH1YGR203W 447 nt12.92□□□□□ -0.34
PUS1Q12211 RPP2AYOL039W 321 nt12.92□□□□□ -0.34
PUS1Q12211 TIR4YOR009W 1464 nt12.91□□□□□ -0.34
PUS1Q12211 IDH1YNL037C 1083 nt12.89□□□□□ -0.35
PUS1Q12211 FPS1YLL043W 2010 nt12.88□□□□□ -0.35
PUS1Q12211 EMI2YDR516C 1503 nt12.87□□□□□ -0.35
PUS1Q12211 YMR090WYMR090W 684 nt12.85□□□□□ -0.35
PUS1Q12211 PCH2YBR186W 1695 nt12.83□□□□□ -0.35
PUS1Q12211 LPX1YOR084W 1164 nt12.83□□□□□ -0.36
PUS1Q12211 PTP1YDL230W 1008 nt12.82□□□□□ -0.36
PUS1Q12211 ERV46YAL042W 1248 nt12.81□□□□□ -0.36
PUS1Q12211 GUT2YIL155C 1950 nt12.81□□□□□ -0.36
PUS1Q12211 ART5YGR068C 1761 nt12.79□□□□□ -0.36
PUS1Q12211 PET9YBL030C 957 nt12.76□□□□□ -0.37
PUS1Q12211 YDR433WYDR433W 441 nt12.75□□□□□ -0.37
PUS1Q12211 SDH1YKL148C 1923 nt12.75□□□□□ -0.37
PUS1Q12211 GFD2YCL036W 1701 nt12.74□□□□□ -0.37
PUS1Q12211 GBP2YCL011C 1284 nt12.73□□□□□ -0.37
PUS1Q12211 SEC11YIR022W 504 nt12.72□□□□□ -0.37
PUS1Q12211 YMR057CYMR057C 372 nt12.72□□□□□ -0.37
PUS1Q12211 CAC2YML102W 1407 nt12.71□□□□□ -0.37
PUS1Q12211 YDL221WYDL221W 552 nt12.7□□□□□ -0.38
PUS1Q12211 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.7□□□□□ -0.38
PUS1Q12211 MRPL8YJL063C 717 nt12.68□□□□□ -0.38
PUS1Q12211 YKR040CYKR040C 504 nt12.67□□□□□ -0.38
PUS1Q12211 SPP1YPL138C 1062 nt12.65□□□□□ -0.38
PUS1Q12211 MXR2YCL033C 507 nt12.63□□□□□ -0.39
PUS1Q12211 PIB2YGL023C 1908 nt12.59□□□□□ -0.39
PUS1Q12211 TCD2YKL027W 1344 nt12.57□□□□□ -0.4
PUS1Q12211 RTS2YOR077W 699 nt12.56□□□□□ -0.4
PUS1Q12211 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt12.53□□□□□ -0.4
PUS1Q12211 YEL076CYEL076C 651 nt12.53□□□□□ -0.4
PUS1Q12211 YLR464WYLR464W 651 nt12.53□□□□□ -0.4
PUS1Q12211 ADO1YJR105W 1023 nt12.52□□□□□ -0.41
PUS1Q12211 UME6YDR207C 2511 nt12.51□□□□□ -0.41
PUS1Q12211 RTG1YOL067C 534 nt12.5□□□□□ -0.41
PUS1Q12211 SCC4YER147C 1875 nt12.49□□□□□ -0.41
PUS1Q12211 IRC15YPL017C 1500 nt12.47□□□□□ -0.41
PUS1Q12211 RRD1YIL153W 1182 nt12.45□□□□□ -0.42
PUS1Q12211 DED1YOR204W 1815 nt12.44□□□□□ -0.42
PUS1Q12211 CUE1YMR264W 612 nt12.44□□□□□ -0.42
PUS1Q12211 RTF1YGL244W 1677 nt12.4□□□□□ -0.42
PUS1Q12211 FRD1YEL047C 1413 nt12.38□□□□□ -0.43
PUS1Q12211 GIS3YLR094C 1509 nt12.37□□□□□ -0.43
PUS1Q12211 YSC84YHR016C 1407 nt12.34□□□□□ -0.43
PUS1Q12211 YCL042WYCL042W 360 nt12.33□□□□□ -0.44
PUS1Q12211 BOR1YNL275W 1731 nt12.32□□□□□ -0.44
PUS1Q12211 SOR2YDL246C 1074 nt12.32□□□□□ -0.44
PUS1Q12211 SOR1YJR159W 1074 nt12.32□□□□□ -0.44
PUS1Q12211 YIL100WYIL100W 354 nt12.3□□□□□ -0.44
PUS1Q12211 FMT1YBL013W 1206 nt12.3□□□□□ -0.44
PUS1Q12211 HUA1YGR268C 597 nt12.29□□□□□ -0.44
PUS1Q12211 FMP52YER004W 696 nt12.26□□□□□ -0.45
PUS1Q12211 YHL050CYHL050C 2094 nt12.25□□□□□ -0.45
PUS1Q12211 PTH1YHR189W 573 nt12.25□□□□□ -0.45
PUS1Q12211 YJL225CYJL225C 5277 nt12.24□□□□□ -0.45
PUS1Q12211 PTK1YKL198C 1989 nt12.23□□□□□ -0.45
PUS1Q12211 UBX6YJL048C 1191 nt12.23□□□□□ -0.45
PUS1Q12211 YLR235CYLR235C 399 nt12.22□□□□□ -0.45
PUS1Q12211 BOP3YNL042W 1191 nt12.22□□□□□ -0.45
PUS1Q12211 YKL030WYKL030W 606 nt12.18□□□□□ -0.46
PUS1Q12211 CWP1YKL096W 720 nt12.18□□□□□ -0.46
PUS1Q12211 ADH2YMR303C 1047 nt12.14□□□□□ -0.47
PUS1Q12211 YGR139WYGR139W 339 nt12.11□□□□□ -0.47
PUS1Q12211 LCB1YMR296C 1677 nt12.1□□□□□ -0.47
PUS1Q12211 YDR094WYDR094W 336 nt12.09□□□□□ -0.47
PUS1Q12211 MCH5YOR306C 1566 nt12.06□□□□□ -0.48
PUS1Q12211 RPM1RPM1 483 nt12.05□□□□□ -0.48
PUS1Q12211 PCM1YEL058W 1674 nt12.05□□□□□ -0.48
PUS1Q12211 RRT12YCR045C 1476 nt12.04□□□□□ -0.48
PUS1Q12211 SNF6YHL025W 999 nt12.04□□□□□ -0.48
PUS1Q12211 DIC1YLR348C 897 nt12.03□□□□□ -0.48
PUS1Q12211 YNL195CYNL195C 786 nt12.03□□□□□ -0.48
PUS1Q12211 TIM23YNR017W 669 nt12.01□□□□□ -0.49
PUS1Q12211 RNQ1YCL028W 1218 nt11.94□□□□□ -0.5
PUS1Q12211 YIH1YCR059C 777 nt11.93□□□□□ -0.5
PUS1Q12211 YLR179CYLR179C 606 nt11.93□□□□□ -0.5
PUS1Q12211 SPT8YLR055C 1809 nt11.91□□□□□ -0.5
PUS1Q12211 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11.91□□□□□ -0.5
PUS1Q12211 YFL054CYFL054C 1941 nt11.9□□□□□ -0.5
PUS1Q12211 ALG12YNR030W 1656 nt11.89□□□□□ -0.51
PUS1Q12211 NCP1YHR042W 2076 nt11.87□□□□□ -0.51
PUS1Q12211 YPR064WYPR064W 420 nt11.86□□□□□ -0.51
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