Protein–RNA interactions for Protein: Q12172

YRR1, Zinc finger transcription factor YRR1, yeastyeast

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRR1Q12172 SUF10tP(AGG)N 72 nt13□□□□□ -0.33
YRR1Q12172 REG2YBR050C 1017 nt12.98□□□□□ -0.33
YRR1Q12172 SIS1YNL007C 1059 nt12.94□□□□□ -0.34
YRR1Q12172 RPP2AYOL039W 321 nt12.91□□□□□ -0.34
YRR1Q12172 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.9□□□□□ -0.34
YRR1Q12172 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.9□□□□□ -0.34
YRR1Q12172 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.9□□□□□ -0.34
YRR1Q12172 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.9□□□□□ -0.34
YRR1Q12172 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.9□□□□□ -0.34
YRR1Q12172 PTP1YDL230W 1008 nt12.89□□□□□ -0.35
YRR1Q12172 DCW1YKL046C 1350 nt12.89□□□□□ -0.35
YRR1Q12172 YLR281CYLR281C 468 nt12.85□□□□□ -0.35
YRR1Q12172 SSA4YER103W 1929 nt12.82□□□□□ -0.36
YRR1Q12172 WHI5YOR083W 888 nt12.81□□□□□ -0.36
YRR1Q12172 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.79□□□□□ -0.36
YRR1Q12172 CAC2YML102W 1407 nt12.77□□□□□ -0.37
YRR1Q12172 EMI2YDR516C 1503 nt12.72□□□□□ -0.37
YRR1Q12172 ART5YGR068C 1761 nt12.72□□□□□ -0.37
YRR1Q12172 TIR4YOR009W 1464 nt12.72□□□□□ -0.37
YRR1Q12172 PUS2YGL063W 1113 nt12.7□□□□□ -0.38
YRR1Q12172 GFD2YCL036W 1701 nt12.68□□□□□ -0.38
YRR1Q12172 YDR509WYDR509W 348 nt12.67□□□□□ -0.38
YRR1Q12172 BUR6YER159C 429 nt12.67□□□□□ -0.38
YRR1Q12172 PET9YBL030C 957 nt12.66□□□□□ -0.38
YRR1Q12172 YCH1YGR203W 447 nt12.65□□□□□ -0.38
YRR1Q12172 YJL152WYJL152W 360 nt12.65□□□□□ -0.38
YRR1Q12172 YDL221WYDL221W 552 nt12.64□□□□□ -0.39
YRR1Q12172 BMT5YIL096C 1011 nt12.61□□□□□ -0.39
YRR1Q12172 YMR090WYMR090W 684 nt12.61□□□□□ -0.39
YRR1Q12172 IRC15YPL017C 1500 nt12.58□□□□□ -0.4
YRR1Q12172 YMR057CYMR057C 372 nt12.57□□□□□ -0.4
YRR1Q12172 Q0010Q0010 387 nt12.55□□□□□ -0.4
YRR1Q12172 DSK2YMR276W 1122 nt12.53□□□□□ -0.4
YRR1Q12172 YPR011CYPR011C 981 nt12.53□□□□□ -0.4
YRR1Q12172 VAR1Q0140 1197 nt12.52□□□□□ -0.41
YRR1Q12172 IMP2'YIL154C 1041 nt12.51□□□□□ -0.41
YRR1Q12172 MRPL8YJL063C 717 nt12.51□□□□□ -0.41
YRR1Q12172 RTS2YOR077W 699 nt12.51□□□□□ -0.41
YRR1Q12172 YLR236CYLR236C 324 nt12.5□□□□□ -0.41
YRR1Q12172 YBR220CYBR220C 1683 nt12.5□□□□□ -0.41
YRR1Q12172 GIS3YLR094C 1509 nt12.48□□□□□ -0.41
YRR1Q12172 SDH1YKL148C 1923 nt12.47□□□□□ -0.41
YRR1Q12172 IDH1YNL037C 1083 nt12.44□□□□□ -0.42
YRR1Q12172 FPS1YLL043W 2010 nt12.43□□□□□ -0.42
YRR1Q12172 CUE1YMR264W 612 nt12.41□□□□□ -0.42
YRR1Q12172 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.41□□□□□ -0.42
YRR1Q12172 SCC4YER147C 1875 nt12.4□□□□□ -0.42
YRR1Q12172 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt12.39□□□□□ -0.43
YRR1Q12172 FMP45YDL222C 930 nt12.37□□□□□ -0.43
YRR1Q12172 ARA2YMR041C 1008 nt12.36□□□□□ -0.43
YRR1Q12172 SRN2YLR119W 642 nt12.35□□□□□ -0.43
YRR1Q12172 GBP2YCL011C 1284 nt12.35□□□□□ -0.43
YRR1Q12172 BDF1YLR399C 2061 nt12.33□□□□□ -0.44
YRR1Q12172 Q0144Q0144 330 nt12.32□□□□□ -0.44
YRR1Q12172 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt12.29□□□□□ -0.44
YRR1Q12172 ERV46YAL042W 1248 nt12.29□□□□□ -0.44
YRR1Q12172 LPX1YOR084W 1164 nt12.28□□□□□ -0.44
YRR1Q12172 SEM1YDR363W-A 270 nt12.27□□□□□ -0.45
YRR1Q12172 YDR433WYDR433W 441 nt12.27□□□□□ -0.45
YRR1Q12172 YIL100WYIL100W 354 nt12.23□□□□□ -0.45
YRR1Q12172 RRD1YIL153W 1182 nt12.23□□□□□ -0.45
YRR1Q12172 UBX6YJL048C 1191 nt12.23□□□□□ -0.45
YRR1Q12172 TCD2YKL027W 1344 nt12.21□□□□□ -0.45
YRR1Q12172 ADO1YJR105W 1023 nt12.21□□□□□ -0.45
YRR1Q12172 YLR122CYLR122C 378 nt12.21□□□□□ -0.45
YRR1Q12172 MXR2YCL033C 507 nt12.21□□□□□ -0.45
YRR1Q12172 DED1YOR204W 1815 nt12.21□□□□□ -0.46
YRR1Q12172 YKR040CYKR040C 504 nt12.2□□□□□ -0.46
YRR1Q12172 MET8YBR213W 825 nt12.2□□□□□ -0.46
YRR1Q12172 TAT1YBR069C 1860 nt12.17□□□□□ -0.46
YRR1Q12172 FMT1YBL013W 1206 nt12.1□□□□□ -0.47
YRR1Q12172 YSC84YHR016C 1407 nt12.09□□□□□ -0.47
YRR1Q12172 CLB6YGR109C 1143 nt12.08□□□□□ -0.48
YRR1Q12172 RRT12YCR045C 1476 nt12.08□□□□□ -0.48
YRR1Q12172 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt12.07□□□□□ -0.48
YRR1Q12172 YEL076CYEL076C 651 nt12.07□□□□□ -0.48
YRR1Q12172 YLR464WYLR464W 651 nt12.07□□□□□ -0.48
YRR1Q12172 ABZ2YMR289W 1125 nt12.07□□□□□ -0.48
YRR1Q12172 SPP1YPL138C 1062 nt12.06□□□□□ -0.48
YRR1Q12172 YHL050CYHL050C 2094 nt12.06□□□□□ -0.48
YRR1Q12172 FMP52YER004W 696 nt12.05□□□□□ -0.48
YRR1Q12172 YNL195CYNL195C 786 nt12.05□□□□□ -0.48
YRR1Q12172 SEC11YIR022W 504 nt12.03□□□□□ -0.48
YRR1Q12172 FRD1YEL047C 1413 nt12.03□□□□□ -0.48
YRR1Q12172 ARP10YDR106W 855 nt12.02□□□□□ -0.49
YRR1Q12172 SOR2YDL246C 1074 nt12□□□□□ -0.49
YRR1Q12172 SOR1YJR159W 1074 nt12□□□□□ -0.49
YRR1Q12172 PCH2YBR186W 1695 nt11.96□□□□□ -0.5
YRR1Q12172 RTG1YOL067C 534 nt11.95□□□□□ -0.5
YRR1Q12172 YCL042WYCL042W 360 nt11.95□□□□□ -0.5
YRR1Q12172 CWP1YKL096W 720 nt11.94□□□□□ -0.5
YRR1Q12172 ADH2YMR303C 1047 nt11.94□□□□□ -0.5
YRR1Q12172 PCM1YEL058W 1674 nt11.93□□□□□ -0.5
YRR1Q12172 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt11.92□□□□□ -0.5
YRR1Q12172 TOM20YGR082W 552 nt11.91□□□□□ -0.5
YRR1Q12172 GUT2YIL155C 1950 nt11.9□□□□□ -0.5
YRR1Q12172 YDR094WYDR094W 336 nt11.85□□□□□ -0.51
YRR1Q12172 LCP5YER127W 1074 nt11.84□□□□□ -0.51
YRR1Q12172 SNF6YHL025W 999 nt11.83□□□□□ -0.52
YRR1Q12172 YCR099CYCR099C 468 nt11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 27.1 ms