Protein–RNA interactions for Protein: Q12118

SGT2, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein 2, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SGT2Q12118 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt13.2□□□□□ -0.3
SGT2Q12118 SIS1YNL007C 1059 nt13.14□□□□□ -0.31
SGT2Q12118 YJL152WYJL152W 360 nt13.11□□□□□ -0.31
SGT2Q12118 MEP2YNL142W 1500 nt13.11□□□□□ -0.31
SGT2Q12118 RPP2AYOL039W 321 nt13.09□□□□□ -0.31
SGT2Q12118 DSK2YMR276W 1122 nt13.04□□□□□ -0.32
SGT2Q12118 IMP2'YIL154C 1041 nt13.03□□□□□ -0.32
SGT2Q12118 YPR011CYPR011C 981 nt12.97□□□□□ -0.33
SGT2Q12118 FMP45YDL222C 930 nt12.96□□□□□ -0.33
SGT2Q12118 PTP1YDL230W 1008 nt12.96□□□□□ -0.33
SGT2Q12118 TIR4YOR009W 1464 nt12.95□□□□□ -0.34
SGT2Q12118 BDF1YLR399C 2061 nt12.95□□□□□ -0.34
SGT2Q12118 YLR236CYLR236C 324 nt12.94□□□□□ -0.34
SGT2Q12118 FPS1YLL043W 2010 nt12.94□□□□□ -0.34
SGT2Q12118 ART5YGR068C 1761 nt12.93□□□□□ -0.34
SGT2Q12118 YCH1YGR203W 447 nt12.91□□□□□ -0.34
SGT2Q12118 DCW1YKL046C 1350 nt12.91□□□□□ -0.34
SGT2Q12118 IDH1YNL037C 1083 nt12.9□□□□□ -0.34
SGT2Q12118 MOT3YMR070W 1473 nt12.9□□□□□ -0.34
SGT2Q12118 PET9YBL030C 957 nt12.89□□□□□ -0.35
SGT2Q12118 YMR057CYMR057C 372 nt12.85□□□□□ -0.35
SGT2Q12118 CAC2YML102W 1407 nt12.85□□□□□ -0.35
SGT2Q12118 GFD2YCL036W 1701 nt12.83□□□□□ -0.36
SGT2Q12118 PAC11YDR488C 1602 nt12.83□□□□□ -0.36
SGT2Q12118 EMI2YDR516C 1503 nt12.78□□□□□ -0.36
SGT2Q12118 YDR433WYDR433W 441 nt12.77□□□□□ -0.37
SGT2Q12118 GBP2YCL011C 1284 nt12.77□□□□□ -0.37
SGT2Q12118 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.77□□□□□ -0.37
SGT2Q12118 TAT1YBR069C 1860 nt12.76□□□□□ -0.37
SGT2Q12118 LPX1YOR084W 1164 nt12.74□□□□□ -0.37
SGT2Q12118 YMR090WYMR090W 684 nt12.73□□□□□ -0.37
SGT2Q12118 ERV46YAL042W 1248 nt12.72□□□□□ -0.37
SGT2Q12118 RTS2YOR077W 699 nt12.69□□□□□ -0.38
SGT2Q12118 YDL221WYDL221W 552 nt12.68□□□□□ -0.38
SGT2Q12118 YKR040CYKR040C 504 nt12.66□□□□□ -0.38
SGT2Q12118 IRC15YPL017C 1500 nt12.63□□□□□ -0.39
SGT2Q12118 NVJ2YPR091C 2313 nt12.63□□□□□ -0.39
SGT2Q12118 TCD2YKL027W 1344 nt12.62□□□□□ -0.39
SGT2Q12118 MXR2YCL033C 507 nt12.61□□□□□ -0.39
SGT2Q12118 Q0182Q0182 405 nt12.59□□□□□ -0.39
SGT2Q12118 CUE1YMR264W 612 nt12.56□□□□□ -0.4
SGT2Q12118 SPP1YPL138C 1062 nt12.56□□□□□ -0.4
SGT2Q12118 GIS3YLR094C 1509 nt12.56□□□□□ -0.4
SGT2Q12118 SDH1YKL148C 1923 nt12.49□□□□□ -0.41
SGT2Q12118 RRD1YIL153W 1182 nt12.48□□□□□ -0.41
SGT2Q12118 SCC4YER147C 1875 nt12.46□□□□□ -0.41
SGT2Q12118 YIL100WYIL100W 354 nt12.46□□□□□ -0.41
SGT2Q12118 DED1YOR204W 1815 nt12.46□□□□□ -0.42
SGT2Q12118 YBR220CYBR220C 1683 nt12.44□□□□□ -0.42
SGT2Q12118 MRPL8YJL063C 717 nt12.43□□□□□ -0.42
SGT2Q12118 YCL042WYCL042W 360 nt12.38□□□□□ -0.43
SGT2Q12118 FRD1YEL047C 1413 nt12.36□□□□□ -0.43
SGT2Q12118 FMT1YBL013W 1206 nt12.35□□□□□ -0.43
SGT2Q12118 ADO1YJR105W 1023 nt12.34□□□□□ -0.43
SGT2Q12118 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt12.32□□□□□ -0.44
SGT2Q12118 YEL076CYEL076C 651 nt12.32□□□□□ -0.44
SGT2Q12118 YLR464WYLR464W 651 nt12.32□□□□□ -0.44
SGT2Q12118 RTG1YOL067C 534 nt12.32□□□□□ -0.44
SGT2Q12118 FMP52YER004W 696 nt12.3□□□□□ -0.44
SGT2Q12118 CWP1YKL096W 720 nt12.27□□□□□ -0.45
SGT2Q12118 SOR2YDL246C 1074 nt12.26□□□□□ -0.45
SGT2Q12118 SOR1YJR159W 1074 nt12.26□□□□□ -0.45
SGT2Q12118 YNL195CYNL195C 786 nt12.26□□□□□ -0.45
SGT2Q12118 PTH1YHR189W 573 nt12.23□□□□□ -0.45
SGT2Q12118 ADH2YMR303C 1047 nt12.21□□□□□ -0.45
SGT2Q12118 YLR235CYLR235C 399 nt12.19□□□□□ -0.46
SGT2Q12118 HUA1YGR268C 597 nt12.18□□□□□ -0.46
SGT2Q12118 PCM1YEL058W 1674 nt12.16□□□□□ -0.46
SGT2Q12118 RRT12YCR045C 1476 nt12.15□□□□□ -0.46
SGT2Q12118 YKL030WYKL030W 606 nt12.15□□□□□ -0.46
SGT2Q12118 SNF6YHL025W 999 nt12.13□□□□□ -0.47
SGT2Q12118 YSC84YHR016C 1407 nt12.11□□□□□ -0.47
SGT2Q12118 LCB1YMR296C 1677 nt12.06□□□□□ -0.48
SGT2Q12118 YHL050CYHL050C 2094 nt12.04□□□□□ -0.48
SGT2Q12118 DIC1YLR348C 897 nt12.03□□□□□ -0.48
SGT2Q12118 PCH2YBR186W 1695 nt12.03□□□□□ -0.48
SGT2Q12118 SEC11YIR022W 504 nt12□□□□□ -0.49
SGT2Q12118 TIM23YNR017W 669 nt12□□□□□ -0.49
SGT2Q12118 RNQ1YCL028W 1218 nt12□□□□□ -0.49
SGT2Q12118 GUT2YIL155C 1950 nt11.99□□□□□ -0.49
SGT2Q12118 YIH1YCR059C 777 nt11.97□□□□□ -0.49
SGT2Q12118 UBX6YJL048C 1191 nt11.97□□□□□ -0.49
SGT2Q12118 YLR179CYLR179C 606 nt11.95□□□□□ -0.5
SGT2Q12118 SIM1YIL123W 1431 nt11.94□□□□□ -0.5
SGT2Q12118 YLL053CYLL053C 459 nt11.89□□□□□ -0.51
SGT2Q12118 BIO4YNR057C 714 nt11.89□□□□□ -0.51
SGT2Q12118 YDR094WYDR094W 336 nt11.87□□□□□ -0.51
SGT2Q12118 YPR064WYPR064W 420 nt11.87□□□□□ -0.51
SGT2Q12118 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11.83□□□□□ -0.52
SGT2Q12118 FTR1YER145C 1215 nt11.8□□□□□ -0.52
SGT2Q12118 AHT1YHR093W 549 nt11.78□□□□□ -0.52
SGT2Q12118 TAD3YLR316C 969 nt11.78□□□□□ -0.52
SGT2Q12118 AQY1YPR192W 918 nt11.78□□□□□ -0.52
SGT2Q12118 GAL1YBR020W 1587 nt11.77□□□□□ -0.53
SGT2Q12118 WSC2YNL283C 1512 nt11.76□□□□□ -0.53
SGT2Q12118 PIB2YGL023C 1908 nt11.76□□□□□ -0.53
SGT2Q12118 TRM5YHR070W 1500 nt11.75□□□□□ -0.53
SGT2Q12118 RPM1RPM1 483 nt11.74□□□□□ -0.53
SGT2Q12118 ERF2YLR246W 1080 nt11.72□□□□□ -0.53
SGT2Q12118 DDR2YOL052C-A 186 nt11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.6 ms