Protein–RNA interactions for Protein: Q12060

HFI1, Transcriptional coactivator HFI1/ADA1, yeastyeast

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HFI1Q12060 YDR095CYDR095C 411 nt13.37□□□□□ -0.27
HFI1Q12060 Q0182Q0182 405 nt13.37□□□□□ -0.27
HFI1Q12060 FMP45YDL222C 930 nt13.33□□□□□ -0.28
HFI1Q12060 YJL152WYJL152W 360 nt13.31□□□□□ -0.28
HFI1Q12060 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.3□□□□□ -0.28
HFI1Q12060 YLR236CYLR236C 324 nt13.25□□□□□ -0.29
HFI1Q12060 SIS1YNL007C 1059 nt13.24□□□□□ -0.29
HFI1Q12060 YPR011CYPR011C 981 nt13.24□□□□□ -0.29
HFI1Q12060 YCH1YGR203W 447 nt13.21□□□□□ -0.29
HFI1Q12060 IDH1YNL037C 1083 nt13.17□□□□□ -0.3
HFI1Q12060 RPP2AYOL039W 321 nt13.15□□□□□ -0.3
HFI1Q12060 TIR4YOR009W 1464 nt13.09□□□□□ -0.31
HFI1Q12060 MEP2YNL142W 1500 nt13.05□□□□□ -0.32
HFI1Q12060 ERV46YAL042W 1248 nt13.04□□□□□ -0.32
HFI1Q12060 LPX1YOR084W 1164 nt13.04□□□□□ -0.32
HFI1Q12060 YDR433WYDR433W 441 nt13.03□□□□□ -0.32
HFI1Q12060 SPT5YML010W 3192 nt13.01□□□□□ -0.33
HFI1Q12060 GBP2YCL011C 1284 nt12.99□□□□□ -0.33
HFI1Q12060 ART5YGR068C 1761 nt12.99□□□□□ -0.33
HFI1Q12060 PET9YBL030C 957 nt12.98□□□□□ -0.33
HFI1Q12060 PTP1YDL230W 1008 nt12.97□□□□□ -0.33
HFI1Q12060 MRPL8YJL063C 717 nt12.97□□□□□ -0.33
HFI1Q12060 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.96□□□□□ -0.33
HFI1Q12060 CAC2YML102W 1407 nt12.95□□□□□ -0.34
HFI1Q12060 YKR040CYKR040C 504 nt12.93□□□□□ -0.34
HFI1Q12060 YMR057CYMR057C 372 nt12.93□□□□□ -0.34
HFI1Q12060 GFD2YCL036W 1701 nt12.9□□□□□ -0.34
HFI1Q12060 ADO1YJR105W 1023 nt12.85□□□□□ -0.35
HFI1Q12060 SPP1YPL138C 1062 nt12.85□□□□□ -0.35
HFI1Q12060 MXR2YCL033C 507 nt12.83□□□□□ -0.36
HFI1Q12060 DCW1YKL046C 1350 nt12.82□□□□□ -0.36
HFI1Q12060 TCD2YKL027W 1344 nt12.82□□□□□ -0.36
HFI1Q12060 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt12.78□□□□□ -0.36
HFI1Q12060 YEL076CYEL076C 651 nt12.78□□□□□ -0.36
HFI1Q12060 YLR464WYLR464W 651 nt12.78□□□□□ -0.36
HFI1Q12060 EMI2YDR516C 1503 nt12.73□□□□□ -0.37
HFI1Q12060 RTG1YOL067C 534 nt12.72□□□□□ -0.37
HFI1Q12060 RTS2YOR077W 699 nt12.72□□□□□ -0.37
HFI1Q12060 YMR090WYMR090W 684 nt12.71□□□□□ -0.37
HFI1Q12060 SSA4YER103W 1929 nt12.68□□□□□ -0.38
HFI1Q12060 FPS1YLL043W 2010 nt12.67□□□□□ -0.38
HFI1Q12060 YDL221WYDL221W 552 nt12.66□□□□□ -0.38
HFI1Q12060 IRC15YPL017C 1500 nt12.62□□□□□ -0.39
HFI1Q12060 RRD1YIL153W 1182 nt12.62□□□□□ -0.39
HFI1Q12060 CUE1YMR264W 612 nt12.62□□□□□ -0.39
HFI1Q12060 DED1YOR204W 1815 nt12.6□□□□□ -0.39
HFI1Q12060 YCL042WYCL042W 360 nt12.6□□□□□ -0.39
HFI1Q12060 HUA1YGR268C 597 nt12.59□□□□□ -0.39
HFI1Q12060 FRD1YEL047C 1413 nt12.58□□□□□ -0.4
HFI1Q12060 YIL100WYIL100W 354 nt12.54□□□□□ -0.4
HFI1Q12060 GIS3YLR094C 1509 nt12.53□□□□□ -0.4
HFI1Q12060 SOR2YDL246C 1074 nt12.5□□□□□ -0.41
HFI1Q12060 SOR1YJR159W 1074 nt12.5□□□□□ -0.41
HFI1Q12060 FMP52YER004W 696 nt12.48□□□□□ -0.41
HFI1Q12060 YLR235CYLR235C 399 nt12.48□□□□□ -0.41
HFI1Q12060 PTH1YHR189W 573 nt12.47□□□□□ -0.41
HFI1Q12060 UBX6YJL048C 1191 nt12.47□□□□□ -0.41
HFI1Q12060 FMT1YBL013W 1206 nt12.47□□□□□ -0.41
HFI1Q12060 YKL030WYKL030W 606 nt12.44□□□□□ -0.42
HFI1Q12060 SDH1YKL148C 1923 nt12.43□□□□□ -0.42
HFI1Q12060 SCC4YER147C 1875 nt12.42□□□□□ -0.42
HFI1Q12060 CWP1YKL096W 720 nt12.4□□□□□ -0.42
HFI1Q12060 YDR094WYDR094W 336 nt12.35□□□□□ -0.43
HFI1Q12060 YBR220CYBR220C 1683 nt12.33□□□□□ -0.44
HFI1Q12060 LCB1YMR296C 1677 nt12.32□□□□□ -0.44
HFI1Q12060 ADH2YMR303C 1047 nt12.32□□□□□ -0.44
HFI1Q12060 YNL195CYNL195C 786 nt12.29□□□□□ -0.44
HFI1Q12060 SNF6YHL025W 999 nt12.27□□□□□ -0.45
HFI1Q12060 PCM1YEL058W 1674 nt12.25□□□□□ -0.45
HFI1Q12060 TIM23YNR017W 669 nt12.24□□□□□ -0.45
HFI1Q12060 BDF1YLR399C 2061 nt12.23□□□□□ -0.45
HFI1Q12060 DIC1YLR348C 897 nt12.23□□□□□ -0.45
HFI1Q12060 YLR179CYLR179C 606 nt12.16□□□□□ -0.46
HFI1Q12060 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt12.15□□□□□ -0.46
HFI1Q12060 RNQ1YCL028W 1218 nt12.15□□□□□ -0.46
HFI1Q12060 YIH1YCR059C 777 nt12.12□□□□□ -0.47
HFI1Q12060 YPR064WYPR064W 420 nt12.12□□□□□ -0.47
HFI1Q12060 RRT12YCR045C 1476 nt12.08□□□□□ -0.48
HFI1Q12060 TAT1YBR069C 1860 nt12.06□□□□□ -0.48
HFI1Q12060 YSC84YHR016C 1407 nt12.05□□□□□ -0.48
HFI1Q12060 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt12.05□□□□□ -0.48
HFI1Q12060 TAD3YLR316C 969 nt12.03□□□□□ -0.48
HFI1Q12060 YFR018CYFR018C 1092 nt12.02□□□□□ -0.49
HFI1Q12060 RRT5YFR032C 870 nt12□□□□□ -0.49
HFI1Q12060 YLL053CYLL053C 459 nt12□□□□□ -0.49
HFI1Q12060 SIM1YIL123W 1431 nt12□□□□□ -0.49
HFI1Q12060 AHT1YHR093W 549 nt11.99□□□□□ -0.49
HFI1Q12060 AQY1YPR192W 918 nt11.99□□□□□ -0.49
HFI1Q12060 BIO4YNR057C 714 nt11.98□□□□□ -0.49
HFI1Q12060 WSC2YNL283C 1512 nt11.96□□□□□ -0.49
HFI1Q12060 YHL050CYHL050C 2094 nt11.96□□□□□ -0.5
HFI1Q12060 PAU16YKL224C 372 nt11.95□□□□□ -0.5
HFI1Q12060 FTR1YER145C 1215 nt11.94□□□□□ -0.5
HFI1Q12060 SEC11YIR022W 504 nt11.94□□□□□ -0.5
HFI1Q12060 GAL1YBR020W 1587 nt11.89□□□□□ -0.51
HFI1Q12060 PRE6YOL038W 765 nt11.87□□□□□ -0.51
HFI1Q12060 TRM5YHR070W 1500 nt11.86□□□□□ -0.51
HFI1Q12060 STB1YNL309W 1263 nt11.83□□□□□ -0.52
HFI1Q12060 ERF2YLR246W 1080 nt11.82□□□□□ -0.52
HFI1Q12060 DDR2YOL052C-A 186 nt11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13 ms