Protein–RNA interactions for Protein: Q08054

CSI2, Chitin synthase 3 complex protein CSI2, yeastyeast

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSI2Q08054 SUF2tP(AGG)C 72 nt10.29□□□□□ -0.76
CSI2Q08054 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.29□□□□□ -0.76
CSI2Q08054 ALF1YNL148C 765 nt10.26□□□□□ -0.77
CSI2Q08054 YPS1YLR120C 1710 nt10.25□□□□□ -0.77
CSI2Q08054 YDR095CYDR095C 411 nt10.23□□□□□ -0.77
CSI2Q08054 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.22□□□□□ -0.77
CSI2Q08054 IMP2'YIL154C 1041 nt10.2□□□□□ -0.78
CSI2Q08054 DSK2YMR276W 1122 nt10.17□□□□□ -0.78
CSI2Q08054 MOT3YMR070W 1473 nt10.15□□□□□ -0.78
CSI2Q08054 YBR220CYBR220C 1683 nt10.15□□□□□ -0.79
CSI2Q08054 DCW1YKL046C 1350 nt10.14□□□□□ -0.79
CSI2Q08054 SIS1YNL007C 1059 nt10.13□□□□□ -0.79
CSI2Q08054 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.1□□□□□ -0.79
CSI2Q08054 YLR236CYLR236C 324 nt10.08□□□□□ -0.8
CSI2Q08054 YPR011CYPR011C 981 nt10.08□□□□□ -0.8
CSI2Q08054 FMP45YDL222C 930 nt10.07□□□□□ -0.8
CSI2Q08054 YJL152WYJL152W 360 nt10.03□□□□□ -0.8
CSI2Q08054 RPP2AYOL039W 321 nt10.03□□□□□ -0.8
CSI2Q08054 YCH1YGR203W 447 nt10.02□□□□□ -0.81
CSI2Q08054 GUT2YIL155C 1950 nt10.02□□□□□ -0.81
CSI2Q08054 PCH2YBR186W 1695 nt10.02□□□□□ -0.81
CSI2Q08054 UME6YDR207C 2511 nt10.01□□□□□ -0.81
CSI2Q08054 IDH1YNL037C 1083 nt9.98□□□□□ -0.81
CSI2Q08054 TIR4YOR009W 1464 nt9.98□□□□□ -0.81
CSI2Q08054 PTP1YDL230W 1008 nt9.96□□□□□ -0.82
CSI2Q08054 ERV46YAL042W 1248 nt9.96□□□□□ -0.82
CSI2Q08054 EMI2YDR516C 1503 nt9.96□□□□□ -0.82
CSI2Q08054 PET9YBL030C 957 nt9.92□□□□□ -0.82
CSI2Q08054 PIB2YGL023C 1908 nt9.92□□□□□ -0.82
CSI2Q08054 YMR090WYMR090W 684 nt9.9□□□□□ -0.82
CSI2Q08054 LPX1YOR084W 1164 nt9.9□□□□□ -0.82
CSI2Q08054 SDH1YKL148C 1923 nt9.9□□□□□ -0.83
CSI2Q08054 ART5YGR068C 1761 nt9.89□□□□□ -0.83
CSI2Q08054 YJL225CYJL225C 5277 nt9.89□□□□□ -0.83
CSI2Q08054 SEC11YIR022W 504 nt9.89□□□□□ -0.83
CSI2Q08054 MRPL8YJL063C 717 nt9.89□□□□□ -0.83
CSI2Q08054 CAC2YML102W 1407 nt9.87□□□□□ -0.83
CSI2Q08054 GFD2YCL036W 1701 nt9.86□□□□□ -0.83
CSI2Q08054 GBP2YCL011C 1284 nt9.84□□□□□ -0.83
CSI2Q08054 YDR433WYDR433W 441 nt9.83□□□□□ -0.84
CSI2Q08054 YKR040CYKR040C 504 nt9.83□□□□□ -0.84
CSI2Q08054 YDL221WYDL221W 552 nt9.82□□□□□ -0.84
CSI2Q08054 YMR057CYMR057C 372 nt9.81□□□□□ -0.84
CSI2Q08054 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt9.81□□□□□ -0.84
CSI2Q08054 ADO1YJR105W 1023 nt9.74□□□□□ -0.85
CSI2Q08054 SPP1YPL138C 1062 nt9.74□□□□□ -0.85
CSI2Q08054 TCD2YKL027W 1344 nt9.73□□□□□ -0.85
CSI2Q08054 MXR2YCL033C 507 nt9.72□□□□□ -0.85
CSI2Q08054 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt9.71□□□□□ -0.86
CSI2Q08054 YEL076CYEL076C 651 nt9.71□□□□□ -0.86
CSI2Q08054 YLR464WYLR464W 651 nt9.71□□□□□ -0.86
CSI2Q08054 RTG1YOL067C 534 nt9.7□□□□□ -0.86
CSI2Q08054 IRC15YPL017C 1500 nt9.68□□□□□ -0.86
CSI2Q08054 SCC4YER147C 1875 nt9.66□□□□□ -0.86
CSI2Q08054 RTS2YOR077W 699 nt9.66□□□□□ -0.86
CSI2Q08054 RTF1YGL244W 1677 nt9.65□□□□□ -0.86
CSI2Q08054 RRD1YIL153W 1182 nt9.65□□□□□ -0.86
CSI2Q08054 CUE1YMR264W 612 nt9.65□□□□□ -0.86
CSI2Q08054 DED1YOR204W 1815 nt9.63□□□□□ -0.87
CSI2Q08054 BOR1YNL275W 1731 nt9.63□□□□□ -0.87
CSI2Q08054 FRD1YEL047C 1413 nt9.6□□□□□ -0.87
CSI2Q08054 GIS3YLR094C 1509 nt9.58□□□□□ -0.88
CSI2Q08054 PTK1YKL198C 1989 nt9.58□□□□□ -0.88
CSI2Q08054 SOR2YDL246C 1074 nt9.58□□□□□ -0.88
CSI2Q08054 SOR1YJR159W 1074 nt9.58□□□□□ -0.88
CSI2Q08054 YSC84YHR016C 1407 nt9.56□□□□□ -0.88
CSI2Q08054 FMP52YER004W 696 nt9.55□□□□□ -0.88
CSI2Q08054 RDN37-1RDN37-1 5354 nt9.54□□□□□ -0.88
CSI2Q08054 RDN37-2RDN37-2 5354 nt9.54□□□□□ -0.88
CSI2Q08054 YCL042WYCL042W 360 nt9.54□□□□□ -0.88
CSI2Q08054 MCH5YOR306C 1566 nt9.54□□□□□ -0.88
CSI2Q08054 YHL050CYHL050C 2094 nt9.53□□□□□ -0.88
CSI2Q08054 HUA1YGR268C 597 nt9.53□□□□□ -0.88
CSI2Q08054 FMT1YBL013W 1206 nt9.52□□□□□ -0.89
CSI2Q08054 YIL100WYIL100W 354 nt9.51□□□□□ -0.89
CSI2Q08054 YLR235CYLR235C 399 nt9.48□□□□□ -0.89
CSI2Q08054 BOP3YNL042W 1191 nt9.48□□□□□ -0.89
CSI2Q08054 UBX6YJL048C 1191 nt9.44□□□□□ -0.9
CSI2Q08054 YKL030WYKL030W 606 nt9.44□□□□□ -0.9
CSI2Q08054 PTH1YHR189W 573 nt9.42□□□□□ -0.9
CSI2Q08054 CWP1YKL096W 720 nt9.4□□□□□ -0.9
CSI2Q08054 YDR094WYDR094W 336 nt9.39□□□□□ -0.91
CSI2Q08054 ALG12YNR030W 1656 nt9.37□□□□□ -0.91
CSI2Q08054 ADH2YMR303C 1047 nt9.37□□□□□ -0.91
CSI2Q08054 LCB1YMR296C 1677 nt9.36□□□□□ -0.91
CSI2Q08054 PCM1YEL058W 1674 nt9.33□□□□□ -0.92
CSI2Q08054 SNF6YHL025W 999 nt9.32□□□□□ -0.92
CSI2Q08054 YNL195CYNL195C 786 nt9.32□□□□□ -0.92
CSI2Q08054 RRT12YCR045C 1476 nt9.31□□□□□ -0.92
CSI2Q08054 DIC1YLR348C 897 nt9.3□□□□□ -0.92
CSI2Q08054 TIM23YNR017W 669 nt9.29□□□□□ -0.92
CSI2Q08054 SPT8YLR055C 1809 nt9.28□□□□□ -0.92
CSI2Q08054 RNQ1YCL028W 1218 nt9.28□□□□□ -0.92
CSI2Q08054 NCP1YHR042W 2076 nt9.27□□□□□ -0.93
CSI2Q08054 YIH1YCR059C 777 nt9.27□□□□□ -0.93
CSI2Q08054 HSP60YLR259C 1719 nt9.25□□□□□ -0.93
CSI2Q08054 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt9.24□□□□□ -0.93
CSI2Q08054 YFL054CYFL054C 1941 nt9.23□□□□□ -0.93
CSI2Q08054 YLR179CYLR179C 606 nt9.22□□□□□ -0.93
CSI2Q08054 YPR064WYPR064W 420 nt9.2□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 1968.3 ms