Protein–RNA interactions for Protein: Q04199

CAC2, Chromatin assembly factor 1 subunit p60, yeastyeast

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CAC2Q04199 PTP1YDL230W 1008 nt10.67□□□□□ -0.7
CAC2Q04199 RPP2AYOL039W 321 nt10.67□□□□□ -0.7
CAC2Q04199 SCC4YER147C 1875 nt10.66□□□□□ -0.7
CAC2Q04199 TRM9YML014W 840 nt10.65□□□□□ -0.7
CAC2Q04199 RKM5YLR137W 1104 nt10.64□□□□□ -0.71
CAC2Q04199 YOR139CYOR139C 393 nt10.62□□□□□ -0.71
CAC2Q04199 CCT6YDR188W 1641 nt10.61□□□□□ -0.71
CAC2Q04199 ALF1YNL148C 765 nt10.6□□□□□ -0.71
CAC2Q04199 IRC15YPL017C 1500 nt10.57□□□□□ -0.72
CAC2Q04199 YOL037CYOL037C 354 nt10.55□□□□□ -0.72
CAC2Q04199 GIS3YLR094C 1509 nt10.51□□□□□ -0.73
CAC2Q04199 YSC84YHR016C 1407 nt10.5□□□□□ -0.73
CAC2Q04199 NPL3YDR432W 1245 nt10.5□□□□□ -0.73
CAC2Q04199 PIB2YGL023C 1908 nt10.5□□□□□ -0.73
CAC2Q04199 SUF2tP(AGG)C 72 nt10.49□□□□□ -0.73
CAC2Q04199 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.49□□□□□ -0.73
CAC2Q04199 SIS1YNL007C 1059 nt10.44□□□□□ -0.74
CAC2Q04199 RTF1YGL244W 1677 nt10.44□□□□□ -0.74
CAC2Q04199 MOT3YMR070W 1473 nt10.4□□□□□ -0.74
CAC2Q04199 YHL050CYHL050C 2094 nt10.4□□□□□ -0.75
CAC2Q04199 UME6YDR207C 2511 nt10.37□□□□□ -0.75
CAC2Q04199 GFD2YCL036W 1701 nt10.36□□□□□ -0.75
CAC2Q04199 RTS2YOR077W 699 nt10.35□□□□□ -0.75
CAC2Q04199 BOP3YNL042W 1191 nt10.33□□□□□ -0.76
CAC2Q04199 ART5YGR068C 1761 nt10.32□□□□□ -0.76
CAC2Q04199 RRT12YCR045C 1476 nt10.31□□□□□ -0.76
CAC2Q04199 YLR281CYLR281C 468 nt10.3□□□□□ -0.76
CAC2Q04199 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.27□□□□□ -0.77
CAC2Q04199 PTK1YKL198C 1989 nt10.26□□□□□ -0.77
CAC2Q04199 TIR4YOR009W 1464 nt10.25□□□□□ -0.77
CAC2Q04199 YNL195CYNL195C 786 nt10.25□□□□□ -0.77
CAC2Q04199 WHI5YOR083W 888 nt10.25□□□□□ -0.77
CAC2Q04199 CUE1YMR264W 612 nt10.23□□□□□ -0.77
CAC2Q04199 PET9YBL030C 957 nt10.22□□□□□ -0.77
CAC2Q04199 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.21□□□□□ -0.77
CAC2Q04199 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.21□□□□□ -0.77
CAC2Q04199 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.21□□□□□ -0.77
CAC2Q04199 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.21□□□□□ -0.77
CAC2Q04199 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.21□□□□□ -0.77
CAC2Q04199 YCH1YGR203W 447 nt10.21□□□□□ -0.77
CAC2Q04199 BOR1YNL275W 1731 nt10.16□□□□□ -0.78
CAC2Q04199 YIL100WYIL100W 354 nt10.14□□□□□ -0.79
CAC2Q04199 PUS2YGL063W 1113 nt10.13□□□□□ -0.79
CAC2Q04199 YJL152WYJL152W 360 nt10.13□□□□□ -0.79
CAC2Q04199 YMR057CYMR057C 372 nt10.1□□□□□ -0.79
CAC2Q04199 YFL054CYFL054C 1941 nt10.07□□□□□ -0.8
CAC2Q04199 IMP2'YIL154C 1041 nt10.05□□□□□ -0.8
CAC2Q04199 NCP1YHR042W 2076 nt10.05□□□□□ -0.8
CAC2Q04199 DSK2YMR276W 1122 nt10.04□□□□□ -0.8
CAC2Q04199 YLR236CYLR236C 324 nt10.03□□□□□ -0.8
CAC2Q04199 YPR011CYPR011C 981 nt10.01□□□□□ -0.81
CAC2Q04199 SPT8YLR055C 1809 nt10□□□□□ -0.81
CAC2Q04199 IDH1YNL037C 1083 nt9.99□□□□□ -0.81
CAC2Q04199 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt9.99□□□□□ -0.81
CAC2Q04199 MCH5YOR306C 1566 nt9.99□□□□□ -0.81
CAC2Q04199 GBP2YCL011C 1284 nt9.91□□□□□ -0.82
CAC2Q04199 FMP45YDL222C 930 nt9.88□□□□□ -0.83
CAC2Q04199 ERV46YAL042W 1248 nt9.88□□□□□ -0.83
CAC2Q04199 RRD1YIL153W 1182 nt9.86□□□□□ -0.83
CAC2Q04199 LCB1YMR296C 1677 nt9.84□□□□□ -0.83
CAC2Q04199 LPX1YOR084W 1164 nt9.84□□□□□ -0.83
CAC2Q04199 YJL225CYJL225C 5277 nt9.83□□□□□ -0.84
CAC2Q04199 HSP60YLR259C 1719 nt9.83□□□□□ -0.84
CAC2Q04199 DED1YOR204W 1815 nt9.82□□□□□ -0.84
CAC2Q04199 YDR433WYDR433W 441 nt9.82□□□□□ -0.84
CAC2Q04199 TCD2YKL027W 1344 nt9.82□□□□□ -0.84
CAC2Q04199 SWE1YJL187C 2460 nt9.79□□□□□ -0.84
CAC2Q04199 MXR2YCL033C 507 nt9.78□□□□□ -0.84
CAC2Q04199 YKR040CYKR040C 504 nt9.77□□□□□ -0.85
CAC2Q04199 ALG12YNR030W 1656 nt9.74□□□□□ -0.85
CAC2Q04199 FMP52YER004W 696 nt9.74□□□□□ -0.85
CAC2Q04199 FMT1YBL013W 1206 nt9.73□□□□□ -0.85
CAC2Q04199 GLK1YCL040W 1503 nt9.7□□□□□ -0.86
CAC2Q04199 SOR2YDL246C 1074 nt9.69□□□□□ -0.86
CAC2Q04199 SOR1YJR159W 1074 nt9.69□□□□□ -0.86
CAC2Q04199 FRD1YEL047C 1413 nt9.66□□□□□ -0.86
CAC2Q04199 SPP1YPL138C 1062 nt9.62□□□□□ -0.87
CAC2Q04199 LYS4YDR234W 2082 nt9.62□□□□□ -0.87
CAC2Q04199 SIM1YIL123W 1431 nt9.61□□□□□ -0.87
CAC2Q04199 PCM1YEL058W 1674 nt9.61□□□□□ -0.87
CAC2Q04199 ADH2YMR303C 1047 nt9.6□□□□□ -0.87
CAC2Q04199 CWP1YKL096W 720 nt9.59□□□□□ -0.87
CAC2Q04199 YCL042WYCL042W 360 nt9.59□□□□□ -0.87
CAC2Q04199 FUR4YBR021W 1902 nt9.56□□□□□ -0.88
CAC2Q04199 SNF6YHL025W 999 nt9.53□□□□□ -0.88
CAC2Q04199 BIO4YNR057C 714 nt9.51□□□□□ -0.89
CAC2Q04199 NAR1YNL240C 1476 nt9.5□□□□□ -0.89
CAC2Q04199 PRP4YPR178W 1398 nt9.49□□□□□ -0.89
CAC2Q04199 YIH1YCR059C 777 nt9.48□□□□□ -0.89
CAC2Q04199 AAC1YMR056C 930 nt9.48□□□□□ -0.89
CAC2Q04199 RTG1YOL067C 534 nt9.45□□□□□ -0.9
CAC2Q04199 RNQ1YCL028W 1218 nt9.45□□□□□ -0.9
CAC2Q04199 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt9.44□□□□□ -0.9
CAC2Q04199 YEL076CYEL076C 651 nt9.44□□□□□ -0.9
CAC2Q04199 YLR464WYLR464W 651 nt9.44□□□□□ -0.9
CAC2Q04199 PTH1YHR189W 573 nt9.42□□□□□ -0.9
CAC2Q04199 YLR235CYLR235C 399 nt9.42□□□□□ -0.9
CAC2Q04199 DIC1YLR348C 897 nt9.42□□□□□ -0.9
CAC2Q04199 DPS1YLL018C 1674 nt9.42□□□□□ -0.9
CAC2Q04199 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt9.39□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.7 ms