Protein–RNA interactions for Protein: Q03790

NUP53, Nucleoporin NUP53, yeastyeast

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NUP53Q03790 FMP45YDL222C 930 nt11.17□□□□□ -0.62
NUP53Q03790 YPR011CYPR011C 981 nt11.16□□□□□ -0.62
NUP53Q03790 YPS1YLR120C 1710 nt11.15□□□□□ -0.62
NUP53Q03790 YDR095CYDR095C 411 nt11.14□□□□□ -0.63
NUP53Q03790 YLR236CYLR236C 324 nt11.13□□□□□ -0.63
NUP53Q03790 YCH1YGR203W 447 nt11.12□□□□□ -0.63
NUP53Q03790 SIS1YNL007C 1059 nt11.07□□□□□ -0.64
NUP53Q03790 MRPL8YJL063C 717 nt11.05□□□□□ -0.64
NUP53Q03790 YJL152WYJL152W 360 nt11.03□□□□□ -0.64
NUP53Q03790 IDH1YNL037C 1083 nt11□□□□□ -0.65
NUP53Q03790 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.99□□□□□ -0.65
NUP53Q03790 ERV46YAL042W 1248 nt10.99□□□□□ -0.65
NUP53Q03790 RPP2AYOL039W 321 nt10.93□□□□□ -0.66
NUP53Q03790 LPX1YOR084W 1164 nt10.93□□□□□ -0.66
NUP53Q03790 TIR4YOR009W 1464 nt10.91□□□□□ -0.66
NUP53Q03790 ADO1YJR105W 1023 nt10.88□□□□□ -0.67
NUP53Q03790 YKR040CYKR040C 504 nt10.87□□□□□ -0.67
NUP53Q03790 YDR433WYDR433W 441 nt10.86□□□□□ -0.67
NUP53Q03790 GBP2YCL011C 1284 nt10.84□□□□□ -0.67
NUP53Q03790 MEP2YNL142W 1500 nt10.84□□□□□ -0.67
NUP53Q03790 SPT5YML010W 3192 nt10.83□□□□□ -0.68
NUP53Q03790 PET9YBL030C 957 nt10.83□□□□□ -0.68
NUP53Q03790 CAC2YML102W 1407 nt10.83□□□□□ -0.68
NUP53Q03790 PTP1YDL230W 1008 nt10.82□□□□□ -0.68
NUP53Q03790 ART5YGR068C 1761 nt10.81□□□□□ -0.68
NUP53Q03790 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.81□□□□□ -0.68
NUP53Q03790 YEL076CYEL076C 651 nt10.81□□□□□ -0.68
NUP53Q03790 YLR464WYLR464W 651 nt10.81□□□□□ -0.68
NUP53Q03790 SPP1YPL138C 1062 nt10.8□□□□□ -0.68
NUP53Q03790 RTG1YOL067C 534 nt10.77□□□□□ -0.69
NUP53Q03790 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.75□□□□□ -0.69
NUP53Q03790 YMR057CYMR057C 372 nt10.74□□□□□ -0.69
NUP53Q03790 GFD2YCL036W 1701 nt10.74□□□□□ -0.69
NUP53Q03790 MXR2YCL033C 507 nt10.71□□□□□ -0.69
NUP53Q03790 TCD2YKL027W 1344 nt10.7□□□□□ -0.7
NUP53Q03790 DCW1YKL046C 1350 nt10.62□□□□□ -0.71
NUP53Q03790 HUA1YGR268C 597 nt10.61□□□□□ -0.71
NUP53Q03790 FPS1YLL043W 2010 nt10.59□□□□□ -0.71
NUP53Q03790 DED1YOR204W 1815 nt10.58□□□□□ -0.72
NUP53Q03790 UBX6YJL048C 1191 nt10.58□□□□□ -0.72
NUP53Q03790 FRD1YEL047C 1413 nt10.57□□□□□ -0.72
NUP53Q03790 RRD1YIL153W 1182 nt10.56□□□□□ -0.72
NUP53Q03790 EMI2YDR516C 1503 nt10.54□□□□□ -0.72
NUP53Q03790 YDL221WYDL221W 552 nt10.51□□□□□ -0.73
NUP53Q03790 CUE1YMR264W 612 nt10.51□□□□□ -0.73
NUP53Q03790 RTS2YOR077W 699 nt10.51□□□□□ -0.73
NUP53Q03790 IRC15YPL017C 1500 nt10.51□□□□□ -0.73
NUP53Q03790 SOR2YDL246C 1074 nt10.5□□□□□ -0.73
NUP53Q03790 SOR1YJR159W 1074 nt10.5□□□□□ -0.73
NUP53Q03790 YMR090WYMR090W 684 nt10.5□□□□□ -0.73
NUP53Q03790 YCL042WYCL042W 360 nt10.49□□□□□ -0.73
NUP53Q03790 YDR094WYDR094W 336 nt10.48□□□□□ -0.73
NUP53Q03790 YLR235CYLR235C 399 nt10.47□□□□□ -0.73
NUP53Q03790 FMP52YER004W 696 nt10.45□□□□□ -0.74
NUP53Q03790 YKL030WYKL030W 606 nt10.44□□□□□ -0.74
NUP53Q03790 FMT1YBL013W 1206 nt10.44□□□□□ -0.74
NUP53Q03790 GIS3YLR094C 1509 nt10.41□□□□□ -0.74
NUP53Q03790 PTH1YHR189W 573 nt10.39□□□□□ -0.75
NUP53Q03790 YIL100WYIL100W 354 nt10.37□□□□□ -0.75
NUP53Q03790 LCB1YMR296C 1677 nt10.33□□□□□ -0.76
NUP53Q03790 SDH1YKL148C 1923 nt10.32□□□□□ -0.76
NUP53Q03790 CWP1YKL096W 720 nt10.31□□□□□ -0.76
NUP53Q03790 SCC4YER147C 1875 nt10.31□□□□□ -0.76
NUP53Q03790 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt10.29□□□□□ -0.76
NUP53Q03790 ADH2YMR303C 1047 nt10.27□□□□□ -0.77
NUP53Q03790 YJL225CYJL225C 5277 nt10.26□□□□□ -0.77
NUP53Q03790 SSA4YER103W 1929 nt10.25□□□□□ -0.77
NUP53Q03790 TIM23YNR017W 669 nt10.24□□□□□ -0.77
NUP53Q03790 YBR220CYBR220C 1683 nt10.24□□□□□ -0.77
NUP53Q03790 PCM1YEL058W 1674 nt10.22□□□□□ -0.77
NUP53Q03790 DIC1YLR348C 897 nt10.22□□□□□ -0.77
NUP53Q03790 PAC11YDR488C 1602 nt10.22□□□□□ -0.77
NUP53Q03790 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.21□□□□□ -0.77
NUP53Q03790 SNF6YHL025W 999 nt10.21□□□□□ -0.77
NUP53Q03790 NVJ2YPR091C 2313 nt10.2□□□□□ -0.78
NUP53Q03790 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.2□□□□□ -0.78
NUP53Q03790 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.2□□□□□ -0.78
NUP53Q03790 YFR018CYFR018C 1092 nt10.18□□□□□ -0.78
NUP53Q03790 RNQ1YCL028W 1218 nt10.17□□□□□ -0.78
NUP53Q03790 YIH1YCR059C 777 nt10.15□□□□□ -0.78
NUP53Q03790 YLR179CYLR179C 606 nt10.15□□□□□ -0.78
NUP53Q03790 YPR064WYPR064W 420 nt10.15□□□□□ -0.78
NUP53Q03790 YNL195CYNL195C 786 nt10.14□□□□□ -0.79
NUP53Q03790 RRT5YFR032C 870 nt10.1□□□□□ -0.79
NUP53Q03790 TAD3YLR316C 969 nt10.1□□□□□ -0.79
NUP53Q03790 AHT1YHR093W 549 nt10.09□□□□□ -0.79
NUP53Q03790 PAU16YKL224C 372 nt10.08□□□□□ -0.8
NUP53Q03790 WSC2YNL283C 1512 nt10.07□□□□□ -0.8
NUP53Q03790 AQY1YPR192W 918 nt10.05□□□□□ -0.8
NUP53Q03790 YLL053CYLL053C 459 nt10□□□□□ -0.81
NUP53Q03790 PRE6YOL038W 765 nt10□□□□□ -0.81
NUP53Q03790 RRT12YCR045C 1476 nt9.99□□□□□ -0.81
NUP53Q03790 BIO4YNR057C 714 nt9.99□□□□□ -0.81
NUP53Q03790 FTR1YER145C 1215 nt9.97□□□□□ -0.81
NUP53Q03790 YSC84YHR016C 1407 nt9.97□□□□□ -0.81
NUP53Q03790 YHL050CYHL050C 2094 nt9.95□□□□□ -0.82
NUP53Q03790 GAL1YBR020W 1587 nt9.94□□□□□ -0.82
NUP53Q03790 SIM1YIL123W 1431 nt9.94□□□□□ -0.82
NUP53Q03790 PEX25YPL112C 1185 nt9.94□□□□□ -0.82
NUP53Q03790 SBA1YKL117W 651 nt9.91□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.2 ms