Protein–RNA interactions for Protein: P53939

NIS1, Protein NIS1, yeastyeast

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NIS1P53939 YBL100CYBL100C 315 nt12.39□□□□□ -0.43
NIS1P53939 YLR236CYLR236C 324 nt12.38□□□□□ -0.43
NIS1P53939 NAB2YGL122C 1578 nt12.36□□□□□ -0.43
NIS1P53939 ADO1YJR105W 1023 nt12.36□□□□□ -0.43
NIS1P53939 TRM9YML014W 840 nt12.34□□□□□ -0.43
NIS1P53939 DAL1YIR027C 1383 nt12.3□□□□□ -0.44
NIS1P53939 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.3□□□□□ -0.44
NIS1P53939 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt12.29□□□□□ -0.44
NIS1P53939 BUD23YCR047C 828 nt12.28□□□□□ -0.44
NIS1P53939 FPR4YLR449W 1179 nt12.26□□□□□ -0.45
NIS1P53939 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt12.25□□□□□ -0.45
NIS1P53939 YEL076CYEL076C 651 nt12.25□□□□□ -0.45
NIS1P53939 YLR464WYLR464W 651 nt12.25□□□□□ -0.45
NIS1P53939 FUN26YAL022C 1554 nt12.25□□□□□ -0.45
NIS1P53939 BUR6YER159C 429 nt12.24□□□□□ -0.45
NIS1P53939 UBX6YJL048C 1191 nt12.24□□□□□ -0.45
NIS1P53939 ARA2YMR041C 1008 nt12.24□□□□□ -0.45
NIS1P53939 Q0010Q0010 387 nt12.24□□□□□ -0.45
NIS1P53939 FIS1YIL065C 468 nt12.22□□□□□ -0.45
NIS1P53939 CCT6YDR188W 1641 nt12.19□□□□□ -0.46
NIS1P53939 PHO4YFR034C 939 nt12.18□□□□□ -0.46
NIS1P53939 ERV46YAL042W 1248 nt12.14□□□□□ -0.47
NIS1P53939 LPX1YOR084W 1164 nt12.14□□□□□ -0.47
NIS1P53939 YLR122CYLR122C 378 nt12.12□□□□□ -0.47
NIS1P53939 RTG1YOL067C 534 nt12.12□□□□□ -0.47
NIS1P53939 SIS1YNL007C 1059 nt12.11□□□□□ -0.47
NIS1P53939 BMT5YIL096C 1011 nt12.1□□□□□ -0.47
NIS1P53939 SPP1YPL138C 1062 nt12.09□□□□□ -0.47
NIS1P53939 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.07□□□□□ -0.48
NIS1P53939 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.07□□□□□ -0.48
NIS1P53939 IDH1YNL037C 1083 nt12.04□□□□□ -0.48
NIS1P53939 YJL152WYJL152W 360 nt12.03□□□□□ -0.48
NIS1P53939 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt11.99□□□□□ -0.49
NIS1P53939 SRN2YLR119W 642 nt11.99□□□□□ -0.49
NIS1P53939 YKR040CYKR040C 504 nt11.98□□□□□ -0.49
NIS1P53939 ALF1YNL148C 765 nt11.98□□□□□ -0.49
NIS1P53939 YDR433WYDR433W 441 nt11.97□□□□□ -0.49
NIS1P53939 FPS1YLL043W 2010 nt11.94□□□□□ -0.5
NIS1P53939 YDR094WYDR094W 336 nt11.93□□□□□ -0.5
NIS1P53939 HUA1YGR268C 597 nt11.93□□□□□ -0.5
NIS1P53939 ABZ2YMR289W 1125 nt11.93□□□□□ -0.5
NIS1P53939 TOM20YGR082W 552 nt11.9□□□□□ -0.5
NIS1P53939 LCP5YER127W 1074 nt11.88□□□□□ -0.51
NIS1P53939 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt11.87□□□□□ -0.51
NIS1P53939 URH1YDR400W 1023 nt11.85□□□□□ -0.51
NIS1P53939 GBP2YCL011C 1284 nt11.83□□□□□ -0.52
NIS1P53939 MXR2YCL033C 507 nt11.78□□□□□ -0.52
NIS1P53939 YDR095CYDR095C 411 nt11.77□□□□□ -0.53
NIS1P53939 YDR509WYDR509W 348 nt11.77□□□□□ -0.53
NIS1P53939 TIR4YOR009W 1464 nt11.74□□□□□ -0.53
NIS1P53939 YPS1YLR120C 1710 nt11.74□□□□□ -0.53
NIS1P53939 AI5_BETAQ0075 1065 nt11.73□□□□□ -0.53
NIS1P53939 NVJ2YPR091C 2313 nt11.66□□□□□ -0.54
NIS1P53939 CAC2YML102W 1407 nt11.65□□□□□ -0.54
NIS1P53939 TCD2YKL027W 1344 nt11.63□□□□□ -0.55
NIS1P53939 SEM1YDR363W-A 270 nt11.62□□□□□ -0.55
NIS1P53939 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.61□□□□□ -0.55
NIS1P53939 ARP10YDR106W 855 nt11.6□□□□□ -0.55
NIS1P53939 YJR154WYJR154W 1041 nt11.6□□□□□ -0.55
NIS1P53939 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.58□□□□□ -0.56
NIS1P53939 YJL118WYJL118W 660 nt11.58□□□□□ -0.56
NIS1P53939 FRD1YEL047C 1413 nt11.56□□□□□ -0.56
NIS1P53939 Q0144Q0144 330 nt11.55□□□□□ -0.56
NIS1P53939 RPP2AYOL039W 321 nt11.55□□□□□ -0.56
NIS1P53939 YKL030WYKL030W 606 nt11.54□□□□□ -0.56
NIS1P53939 SBA1YKL117W 651 nt11.53□□□□□ -0.56
NIS1P53939 PET9YBL030C 957 nt11.53□□□□□ -0.56
NIS1P53939 YMR057CYMR057C 372 nt11.53□□□□□ -0.56
NIS1P53939 HMT1YBR034C 1047 nt11.53□□□□□ -0.56
NIS1P53939 YLR235CYLR235C 399 nt11.51□□□□□ -0.57
NIS1P53939 UTP6YDR449C 1323 nt11.51□□□□□ -0.57
NIS1P53939 ART5YGR068C 1761 nt11.51□□□□□ -0.57
NIS1P53939 PTH1YHR189W 573 nt11.49□□□□□ -0.57
NIS1P53939 DED1YOR204W 1815 nt11.46□□□□□ -0.57
NIS1P53939 PAC11YDR488C 1602 nt11.45□□□□□ -0.58
NIS1P53939 PAU16YKL224C 372 nt11.44□□□□□ -0.58
NIS1P53939 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt11.44□□□□□ -0.58
NIS1P53939 YCL042WYCL042W 360 nt11.44□□□□□ -0.58
NIS1P53939 YHM2YMR241W 945 nt11.42□□□□□ -0.58
NIS1P53939 GFD2YCL036W 1701 nt11.41□□□□□ -0.58
NIS1P53939 PTP1YDL230W 1008 nt11.41□□□□□ -0.58
NIS1P53939 RRD1YIL153W 1182 nt11.41□□□□□ -0.58
NIS1P53939 YPL071CYPL071C 471 nt11.41□□□□□ -0.58
NIS1P53939 LCB1YMR296C 1677 nt11.4□□□□□ -0.58
NIS1P53939 PAB1YER165W 1734 nt11.4□□□□□ -0.58
NIS1P53939 SOR2YDL246C 1074 nt11.39□□□□□ -0.59
NIS1P53939 YFR018CYFR018C 1092 nt11.39□□□□□ -0.59
NIS1P53939 SOR1YJR159W 1074 nt11.39□□□□□ -0.59
NIS1P53939 RRT5YFR032C 870 nt11.38□□□□□ -0.59
NIS1P53939 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11.31□□□□□ -0.6
NIS1P53939 FMT1YBL013W 1206 nt11.3□□□□□ -0.6
NIS1P53939 SKG1YKR100C 1068 nt11.29□□□□□ -0.6
NIS1P53939 COG1YGL223C 1254 nt11.27□□□□□ -0.61
NIS1P53939 YPL041CYPL041C 624 nt11.27□□□□□ -0.61
NIS1P53939 PET20YPL159C 762 nt11.25□□□□□ -0.61
NIS1P53939 YCR099CYCR099C 468 nt11.24□□□□□ -0.61
NIS1P53939 PRE6YOL038W 765 nt11.24□□□□□ -0.61
NIS1P53939 FTH1YBR207W 1398 nt11.24□□□□□ -0.61
NIS1P53939 MEP2YNL142W 1500 nt11.24□□□□□ -0.61
NIS1P53939 FMP52YER004W 696 nt11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.2 ms