Protein–RNA interactions for Protein: P47050

RTT101, Cullin-8, yeastyeast

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Length 842 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTT101P47050 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.66□□□□□ -0.38
RTT101P47050 SIS1YNL007C 1059 nt12.6□□□□□ -0.39
RTT101P47050 MEP2YNL142W 1500 nt12.58□□□□□ -0.4
RTT101P47050 YJL152WYJL152W 360 nt12.56□□□□□ -0.4
RTT101P47050 RPP2AYOL039W 321 nt12.54□□□□□ -0.4
RTT101P47050 DSK2YMR276W 1122 nt12.52□□□□□ -0.41
RTT101P47050 IMP2'YIL154C 1041 nt12.51□□□□□ -0.41
RTT101P47050 TIR4YOR009W 1464 nt12.43□□□□□ -0.42
RTT101P47050 FMP45YDL222C 930 nt12.43□□□□□ -0.42
RTT101P47050 PTP1YDL230W 1008 nt12.42□□□□□ -0.42
RTT101P47050 YLR236CYLR236C 324 nt12.42□□□□□ -0.42
RTT101P47050 YPR011CYPR011C 981 nt12.42□□□□□ -0.42
RTT101P47050 ART5YGR068C 1761 nt12.39□□□□□ -0.43
RTT101P47050 YCH1YGR203W 447 nt12.39□□□□□ -0.43
RTT101P47050 DCW1YKL046C 1350 nt12.39□□□□□ -0.43
RTT101P47050 BDF1YLR399C 2061 nt12.39□□□□□ -0.43
RTT101P47050 MOT3YMR070W 1473 nt12.38□□□□□ -0.43
RTT101P47050 IDH1YNL037C 1083 nt12.37□□□□□ -0.43
RTT101P47050 PET9YBL030C 957 nt12.35□□□□□ -0.43
RTT101P47050 GFD2YCL036W 1701 nt12.31□□□□□ -0.44
RTT101P47050 CAC2YML102W 1407 nt12.3□□□□□ -0.44
RTT101P47050 YMR057CYMR057C 372 nt12.3□□□□□ -0.44
RTT101P47050 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.25□□□□□ -0.45
RTT101P47050 EMI2YDR516C 1503 nt12.24□□□□□ -0.45
RTT101P47050 GBP2YCL011C 1284 nt12.24□□□□□ -0.45
RTT101P47050 YDR433WYDR433W 441 nt12.23□□□□□ -0.45
RTT101P47050 LPX1YOR084W 1164 nt12.23□□□□□ -0.45
RTT101P47050 ERV46YAL042W 1248 nt12.22□□□□□ -0.45
RTT101P47050 TAT1YBR069C 1860 nt12.19□□□□□ -0.46
RTT101P47050 YMR090WYMR090W 684 nt12.19□□□□□ -0.46
RTT101P47050 YDL221WYDL221W 552 nt12.16□□□□□ -0.46
RTT101P47050 RTS2YOR077W 699 nt12.16□□□□□ -0.46
RTT101P47050 YKR040CYKR040C 504 nt12.13□□□□□ -0.47
RTT101P47050 IRC15YPL017C 1500 nt12.11□□□□□ -0.47
RTT101P47050 YBR220CYBR220C 1683 nt12.1□□□□□ -0.47
RTT101P47050 MXR2YCL033C 507 nt12.09□□□□□ -0.47
RTT101P47050 TCD2YKL027W 1344 nt12.09□□□□□ -0.47
RTT101P47050 FPS1YLL043W 2010 nt12.08□□□□□ -0.48
RTT101P47050 CUE1YMR264W 612 nt12.05□□□□□ -0.48
RTT101P47050 SPP1YPL138C 1062 nt12.03□□□□□ -0.48
RTT101P47050 GIS3YLR094C 1509 nt12.02□□□□□ -0.48
RTT101P47050 SDH1YKL148C 1923 nt12.01□□□□□ -0.49
RTT101P47050 RRD1YIL153W 1182 nt11.96□□□□□ -0.49
RTT101P47050 DED1YOR204W 1815 nt11.95□□□□□ -0.5
RTT101P47050 MRPL8YJL063C 717 nt11.95□□□□□ -0.5
RTT101P47050 SCC4YER147C 1875 nt11.95□□□□□ -0.5
RTT101P47050 YIL100WYIL100W 354 nt11.94□□□□□ -0.5
RTT101P47050 YCL042WYCL042W 360 nt11.87□□□□□ -0.51
RTT101P47050 FRD1YEL047C 1413 nt11.86□□□□□ -0.51
RTT101P47050 ADO1YJR105W 1023 nt11.84□□□□□ -0.51
RTT101P47050 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.83□□□□□ -0.52
RTT101P47050 YEL076CYEL076C 651 nt11.83□□□□□ -0.52
RTT101P47050 YLR464WYLR464W 651 nt11.83□□□□□ -0.52
RTT101P47050 FMT1YBL013W 1206 nt11.83□□□□□ -0.52
RTT101P47050 RTG1YOL067C 534 nt11.83□□□□□ -0.52
RTT101P47050 FMP52YER004W 696 nt11.81□□□□□ -0.52
RTT101P47050 PAC11YDR488C 1602 nt11.81□□□□□ -0.52
RTT101P47050 SOR2YDL246C 1074 nt11.8□□□□□ -0.52
RTT101P47050 SOR1YJR159W 1074 nt11.8□□□□□ -0.52
RTT101P47050 YNL195CYNL195C 786 nt11.75□□□□□ -0.53
RTT101P47050 CWP1YKL096W 720 nt11.74□□□□□ -0.53
RTT101P47050 PTH1YHR189W 573 nt11.73□□□□□ -0.53
RTT101P47050 PCH2YBR186W 1695 nt11.69□□□□□ -0.54
RTT101P47050 SEC11YIR022W 504 nt11.69□□□□□ -0.54
RTT101P47050 YLR235CYLR235C 399 nt11.69□□□□□ -0.54
RTT101P47050 ADH2YMR303C 1047 nt11.69□□□□□ -0.54
RTT101P47050 HUA1YGR268C 597 nt11.68□□□□□ -0.54
RTT101P47050 YSC84YHR016C 1407 nt11.65□□□□□ -0.54
RTT101P47050 PCM1YEL058W 1674 nt11.65□□□□□ -0.55
RTT101P47050 YKL030WYKL030W 606 nt11.64□□□□□ -0.55
RTT101P47050 GUT2YIL155C 1950 nt11.63□□□□□ -0.55
RTT101P47050 SNF6YHL025W 999 nt11.63□□□□□ -0.55
RTT101P47050 RRT12YCR045C 1476 nt11.63□□□□□ -0.55
RTT101P47050 YHL050CYHL050C 2094 nt11.58□□□□□ -0.56
RTT101P47050 LCB1YMR296C 1677 nt11.57□□□□□ -0.56
RTT101P47050 DIC1YLR348C 897 nt11.55□□□□□ -0.56
RTT101P47050 TIM23YNR017W 669 nt11.52□□□□□ -0.57
RTT101P47050 RNQ1YCL028W 1218 nt11.5□□□□□ -0.57
RTT101P47050 YIH1YCR059C 777 nt11.49□□□□□ -0.57
RTT101P47050 UBX6YJL048C 1191 nt11.48□□□□□ -0.57
RTT101P47050 NVJ2YPR091C 2313 nt11.47□□□□□ -0.57
RTT101P47050 PIB2YGL023C 1908 nt11.46□□□□□ -0.58
RTT101P47050 YLR179CYLR179C 606 nt11.45□□□□□ -0.58
RTT101P47050 SIM1YIL123W 1431 nt11.43□□□□□ -0.58
RTT101P47050 BIO4YNR057C 714 nt11.41□□□□□ -0.58
RTT101P47050 YDR094WYDR094W 336 nt11.4□□□□□ -0.58
RTT101P47050 RTF1YGL244W 1677 nt11.4□□□□□ -0.59
RTT101P47050 YLL053CYLL053C 459 nt11.39□□□□□ -0.59
RTT101P47050 YPR064WYPR064W 420 nt11.38□□□□□ -0.59
RTT101P47050 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11.35□□□□□ -0.59
RTT101P47050 BOP3YNL042W 1191 nt11.34□□□□□ -0.59
RTT101P47050 FTR1YER145C 1215 nt11.32□□□□□ -0.6
RTT101P47050 AHT1YHR093W 549 nt11.3□□□□□ -0.6
RTT101P47050 TAD3YLR316C 969 nt11.3□□□□□ -0.6
RTT101P47050 AQY1YPR192W 918 nt11.3□□□□□ -0.6
RTT101P47050 WSC2YNL283C 1512 nt11.3□□□□□ -0.6
RTT101P47050 GAL1YBR020W 1587 nt11.28□□□□□ -0.6
RTT101P47050 TRM5YHR070W 1500 nt11.26□□□□□ -0.61
RTT101P47050 ERF2YLR246W 1080 nt11.24□□□□□ -0.61
RTT101P47050 PTK1YKL198C 1989 nt11.23□□□□□ -0.61
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