Protein–RNA interactions for Protein: P08425

MSF1, Phenylalanine--tRNA ligase, mitochondrial, yeastyeast

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSF1P08425 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.33□□□□□ -0.44
MSF1P08425 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.33□□□□□ -0.44
MSF1P08425 YPS1YLR120C 1710 nt12.32□□□□□ -0.44
MSF1P08425 YCH1YGR203W 447 nt12.31□□□□□ -0.44
MSF1P08425 ALF1YNL148C 765 nt12.31□□□□□ -0.44
MSF1P08425 YDR095CYDR095C 411 nt12.23□□□□□ -0.45
MSF1P08425 MEP2YNL142W 1500 nt12.22□□□□□ -0.45
MSF1P08425 MRPL8YJL063C 717 nt12.2□□□□□ -0.46
MSF1P08425 YJL152WYJL152W 360 nt12.2□□□□□ -0.46
MSF1P08425 SIS1YNL007C 1059 nt12.15□□□□□ -0.46
MSF1P08425 ERV46YAL042W 1248 nt12.14□□□□□ -0.47
MSF1P08425 LPX1YOR084W 1164 nt12.14□□□□□ -0.47
MSF1P08425 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.11□□□□□ -0.47
MSF1P08425 IDH1YNL037C 1083 nt12.11□□□□□ -0.47
MSF1P08425 SSA4YER103W 1929 nt12.1□□□□□ -0.47
MSF1P08425 DCW1YKL046C 1350 nt12.07□□□□□ -0.48
MSF1P08425 SPP1YPL138C 1062 nt12.06□□□□□ -0.48
MSF1P08425 TIR4YOR009W 1464 nt12.04□□□□□ -0.48
MSF1P08425 PTP1YDL230W 1008 nt12.02□□□□□ -0.49
MSF1P08425 YDR433WYDR433W 441 nt12.02□□□□□ -0.49
MSF1P08425 ADO1YJR105W 1023 nt12.02□□□□□ -0.49
MSF1P08425 YKR040CYKR040C 504 nt12.01□□□□□ -0.49
MSF1P08425 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.99□□□□□ -0.49
MSF1P08425 YEL076CYEL076C 651 nt11.99□□□□□ -0.49
MSF1P08425 YLR464WYLR464W 651 nt11.99□□□□□ -0.49
MSF1P08425 RPP2AYOL039W 321 nt11.99□□□□□ -0.49
MSF1P08425 RTG1YOL067C 534 nt11.97□□□□□ -0.49
MSF1P08425 GBP2YCL011C 1284 nt11.97□□□□□ -0.49
MSF1P08425 CAC2YML102W 1407 nt11.93□□□□□ -0.5
MSF1P08425 MXR2YCL033C 507 nt11.91□□□□□ -0.5
MSF1P08425 ART5YGR068C 1761 nt11.91□□□□□ -0.5
MSF1P08425 PET9YBL030C 957 nt11.89□□□□□ -0.51
MSF1P08425 YMR057CYMR057C 372 nt11.88□□□□□ -0.51
MSF1P08425 EMI2YDR516C 1503 nt11.87□□□□□ -0.51
MSF1P08425 UBX6YJL048C 1191 nt11.86□□□□□ -0.51
MSF1P08425 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.83□□□□□ -0.52
MSF1P08425 GFD2YCL036W 1701 nt11.82□□□□□ -0.52
MSF1P08425 YDL221WYDL221W 552 nt11.79□□□□□ -0.52
MSF1P08425 TCD2YKL027W 1344 nt11.78□□□□□ -0.52
MSF1P08425 IRC15YPL017C 1500 nt11.75□□□□□ -0.53
MSF1P08425 HUA1YGR268C 597 nt11.72□□□□□ -0.53
MSF1P08425 YBR220CYBR220C 1683 nt11.71□□□□□ -0.53
MSF1P08425 DED1YOR204W 1815 nt11.7□□□□□ -0.54
MSF1P08425 BDF1YLR399C 2061 nt11.7□□□□□ -0.54
MSF1P08425 FRD1YEL047C 1413 nt11.69□□□□□ -0.54
MSF1P08425 YMR090WYMR090W 684 nt11.68□□□□□ -0.54
MSF1P08425 SDH1YKL148C 1923 nt11.67□□□□□ -0.54
MSF1P08425 RRD1YIL153W 1182 nt11.67□□□□□ -0.54
MSF1P08425 FPS1YLL043W 2010 nt11.67□□□□□ -0.54
MSF1P08425 GIS3YLR094C 1509 nt11.64□□□□□ -0.55
MSF1P08425 RTS2YOR077W 699 nt11.63□□□□□ -0.55
MSF1P08425 YDR094WYDR094W 336 nt11.62□□□□□ -0.55
MSF1P08425 SCC4YER147C 1875 nt11.57□□□□□ -0.56
MSF1P08425 FMT1YBL013W 1206 nt11.57□□□□□ -0.56
MSF1P08425 PTH1YHR189W 573 nt11.56□□□□□ -0.56
MSF1P08425 YCL042WYCL042W 360 nt11.56□□□□□ -0.56
MSF1P08425 SOR2YDL246C 1074 nt11.54□□□□□ -0.56
MSF1P08425 SOR1YJR159W 1074 nt11.54□□□□□ -0.56
MSF1P08425 YKL030WYKL030W 606 nt11.54□□□□□ -0.56
MSF1P08425 TAT1YBR069C 1860 nt11.54□□□□□ -0.56
MSF1P08425 CUE1YMR264W 612 nt11.53□□□□□ -0.56
MSF1P08425 YLR235CYLR235C 399 nt11.52□□□□□ -0.57
MSF1P08425 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt11.48□□□□□ -0.57
MSF1P08425 FMP52YER004W 696 nt11.45□□□□□ -0.58
MSF1P08425 LCB1YMR296C 1677 nt11.45□□□□□ -0.58
MSF1P08425 CWP1YKL096W 720 nt11.4□□□□□ -0.58
MSF1P08425 YIL100WYIL100W 354 nt11.37□□□□□ -0.59
MSF1P08425 ADH2YMR303C 1047 nt11.37□□□□□ -0.59
MSF1P08425 YHL050CYHL050C 2094 nt11.31□□□□□ -0.6
MSF1P08425 YSC84YHR016C 1407 nt11.3□□□□□ -0.6
MSF1P08425 TIM23YNR017W 669 nt11.3□□□□□ -0.6
MSF1P08425 RRT12YCR045C 1476 nt11.27□□□□□ -0.6
MSF1P08425 DIC1YLR348C 897 nt11.27□□□□□ -0.61
MSF1P08425 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11.26□□□□□ -0.61
MSF1P08425 Q0182Q0182 405 nt11.26□□□□□ -0.61
MSF1P08425 PCM1YEL058W 1674 nt11.26□□□□□ -0.61
MSF1P08425 YFR018CYFR018C 1092 nt11.25□□□□□ -0.61
MSF1P08425 SNF6YHL025W 999 nt11.23□□□□□ -0.61
MSF1P08425 PAU16YKL224C 372 nt11.23□□□□□ -0.61
MSF1P08425 PCH2YBR186W 1695 nt11.23□□□□□ -0.61
MSF1P08425 SEC11YIR022W 504 nt11.22□□□□□ -0.61
MSF1P08425 YLR179CYLR179C 606 nt11.21□□□□□ -0.61
MSF1P08425 RNQ1YCL028W 1218 nt11.19□□□□□ -0.62
MSF1P08425 GUT2YIL155C 1950 nt11.19□□□□□ -0.62
MSF1P08425 YPR064WYPR064W 420 nt11.18□□□□□ -0.62
MSF1P08425 YIH1YCR059C 777 nt11.17□□□□□ -0.62
MSF1P08425 RRT5YFR032C 870 nt11.17□□□□□ -0.62
MSF1P08425 PRE6YOL038W 765 nt11.16□□□□□ -0.62
MSF1P08425 TAD3YLR316C 969 nt11.14□□□□□ -0.63
MSF1P08425 YNL195CYNL195C 786 nt11.13□□□□□ -0.63
MSF1P08425 WSC2YNL283C 1512 nt11.13□□□□□ -0.63
MSF1P08425 PIB2YGL023C 1908 nt11.13□□□□□ -0.63
MSF1P08425 AHT1YHR093W 549 nt11.12□□□□□ -0.63
MSF1P08425 SBA1YKL117W 651 nt11.12□□□□□ -0.63
MSF1P08425 YLL053CYLL053C 459 nt11.03□□□□□ -0.64
MSF1P08425 NCP1YHR042W 2076 nt11.03□□□□□ -0.64
MSF1P08425 YFL066CYFL066C 1179 nt11.01□□□□□ -0.65
MSF1P08425 AQY1YPR192W 918 nt11□□□□□ -0.65
MSF1P08425 FTR1YER145C 1215 nt10.99□□□□□ -0.65
MSF1P08425 BIO4YNR057C 714 nt10.99□□□□□ -0.65
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