Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C4

TPRKB, EKC/KEOPS complex subunit TPRKB, humanhuman

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRKBQ9Y3C4 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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TPRKBQ9Y3C4 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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TPRKBQ9Y3C4 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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TPRKBQ9Y3C4 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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TPRKBQ9Y3C4 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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TPRKBQ9Y3C4 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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TPRKBQ9Y3C4 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRKBQ9Y3C4 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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