Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X7

GIT1, ARF GTPase-activating protein GIT1, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIT1Q9Y2X7 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GIT1Q9Y2X7 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GIT1Q9Y2X7 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GIT1Q9Y2X7 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GIT1Q9Y2X7 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GIT1Q9Y2X7 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GIT1Q9Y2X7 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GIT1Q9Y2X7 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GIT1Q9Y2X7 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GIT1Q9Y2X7 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GIT1Q9Y2X7 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GIT1Q9Y2X7 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GIT1Q9Y2X7 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GIT1Q9Y2X7 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GIT1Q9Y2X7 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GIT1Q9Y2X7 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GIT1Q9Y2X7 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GIT1Q9Y2X7 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GIT1Q9Y2X7 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GIT1Q9Y2X7 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GIT1Q9Y2X7 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GIT1Q9Y2X7 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GIT1Q9Y2X7 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GIT1Q9Y2X7 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GIT1Q9Y2X7 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GIT1Q9Y2X7 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GIT1Q9Y2X7 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GIT1Q9Y2X7 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GIT1Q9Y2X7 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GIT1Q9Y2X7 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GIT1Q9Y2X7 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GIT1Q9Y2X7 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GIT1Q9Y2X7 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GIT1Q9Y2X7 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GIT1Q9Y2X7 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GIT1Q9Y2X7 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GIT1Q9Y2X7 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GIT1Q9Y2X7 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GIT1Q9Y2X7 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GIT1Q9Y2X7 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GIT1Q9Y2X7 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GIT1Q9Y2X7 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GIT1Q9Y2X7 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GIT1Q9Y2X7 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GIT1Q9Y2X7 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GIT1Q9Y2X7 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GIT1Q9Y2X7 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GIT1Q9Y2X7 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GIT1Q9Y2X7 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GIT1Q9Y2X7 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GIT1Q9Y2X7 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GIT1Q9Y2X7 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GIT1Q9Y2X7 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GIT1Q9Y2X7 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GIT1Q9Y2X7 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GIT1Q9Y2X7 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GIT1Q9Y2X7 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GIT1Q9Y2X7 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GIT1Q9Y2X7 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GIT1Q9Y2X7 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GIT1Q9Y2X7 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GIT1Q9Y2X7 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GIT1Q9Y2X7 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GIT1Q9Y2X7 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GIT1Q9Y2X7 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GIT1Q9Y2X7 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GIT1Q9Y2X7 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GIT1Q9Y2X7 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GIT1Q9Y2X7 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GIT1Q9Y2X7 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GIT1Q9Y2X7 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GIT1Q9Y2X7 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GIT1Q9Y2X7 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GIT1Q9Y2X7 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GIT1Q9Y2X7 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GIT1Q9Y2X7 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GIT1Q9Y2X7 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GIT1Q9Y2X7 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GIT1Q9Y2X7 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GIT1Q9Y2X7 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GIT1Q9Y2X7 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GIT1Q9Y2X7 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GIT1Q9Y2X7 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GIT1Q9Y2X7 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GIT1Q9Y2X7 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GIT1Q9Y2X7 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GIT1Q9Y2X7 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GIT1Q9Y2X7 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GIT1Q9Y2X7 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GIT1Q9Y2X7 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GIT1Q9Y2X7 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GIT1Q9Y2X7 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GIT1Q9Y2X7 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GIT1Q9Y2X7 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GIT1Q9Y2X7 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GIT1Q9Y2X7 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GIT1Q9Y2X7 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GIT1Q9Y2X7 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GIT1Q9Y2X7 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GIT1Q9Y2X7 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms