Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T2

AP3M1, AP-3 complex subunit mu-1, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M1Q9Y2T2 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms