Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC4Q9Y296 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC4Q9Y296 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC4Q9Y296 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC4Q9Y296 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC4Q9Y296 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC4Q9Y296 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC4Q9Y296 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC4Q9Y296 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC4Q9Y296 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC4Q9Y296 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC4Q9Y296 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC4Q9Y296 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC4Q9Y296 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC4Q9Y296 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC4Q9Y296 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC4Q9Y296 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC4Q9Y296 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC4Q9Y296 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC4Q9Y296 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC4Q9Y296 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC4Q9Y296 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC4Q9Y296 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC4Q9Y296 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC4Q9Y296 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC4Q9Y296 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC4Q9Y296 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC4Q9Y296 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC4Q9Y296 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC4Q9Y296 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC4Q9Y296 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC4Q9Y296 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC4Q9Y296 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC4Q9Y296 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC4Q9Y296 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC4Q9Y296 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC4Q9Y296 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC4Q9Y296 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC4Q9Y296 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC4Q9Y296 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC4Q9Y296 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC4Q9Y296 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC4Q9Y296 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC4Q9Y296 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC4Q9Y296 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC4Q9Y296 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC4Q9Y296 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC4Q9Y296 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC4Q9Y296 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC4Q9Y296 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC4Q9Y296 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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