Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms