Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms