Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYTH4Q9UIA0 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYTH4Q9UIA0 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYTH4Q9UIA0 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYTH4Q9UIA0 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYTH4Q9UIA0 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYTH4Q9UIA0 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYTH4Q9UIA0 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYTH4Q9UIA0 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYTH4Q9UIA0 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYTH4Q9UIA0 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYTH4Q9UIA0 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYTH4Q9UIA0 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYTH4Q9UIA0 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYTH4Q9UIA0 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYTH4Q9UIA0 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYTH4Q9UIA0 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYTH4Q9UIA0 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYTH4Q9UIA0 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYTH4Q9UIA0 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYTH4Q9UIA0 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYTH4Q9UIA0 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYTH4Q9UIA0 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CYTH4Q9UIA0 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CYTH4Q9UIA0 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYTH4Q9UIA0 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYTH4Q9UIA0 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYTH4Q9UIA0 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYTH4Q9UIA0 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYTH4Q9UIA0 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYTH4Q9UIA0 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYTH4Q9UIA0 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYTH4Q9UIA0 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYTH4Q9UIA0 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYTH4Q9UIA0 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYTH4Q9UIA0 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYTH4Q9UIA0 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYTH4Q9UIA0 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYTH4Q9UIA0 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYTH4Q9UIA0 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYTH4Q9UIA0 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYTH4Q9UIA0 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CYTH4Q9UIA0 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYTH4Q9UIA0 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CYTH4Q9UIA0 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CYTH4Q9UIA0 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CYTH4Q9UIA0 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CYTH4Q9UIA0 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CYTH4Q9UIA0 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CYTH4Q9UIA0 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CYTH4Q9UIA0 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CYTH4Q9UIA0 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CYTH4Q9UIA0 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CYTH4Q9UIA0 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CYTH4Q9UIA0 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CYTH4Q9UIA0 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CYTH4Q9UIA0 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CYTH4Q9UIA0 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CYTH4Q9UIA0 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYTH4Q9UIA0 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYTH4Q9UIA0 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYTH4Q9UIA0 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYTH4Q9UIA0 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYTH4Q9UIA0 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYTH4Q9UIA0 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYTH4Q9UIA0 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYTH4Q9UIA0 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYTH4Q9UIA0 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYTH4Q9UIA0 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYTH4Q9UIA0 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYTH4Q9UIA0 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYTH4Q9UIA0 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYTH4Q9UIA0 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYTH4Q9UIA0 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYTH4Q9UIA0 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYTH4Q9UIA0 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYTH4Q9UIA0 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYTH4Q9UIA0 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYTH4Q9UIA0 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYTH4Q9UIA0 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYTH4Q9UIA0 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYTH4Q9UIA0 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CYTH4Q9UIA0 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CYTH4Q9UIA0 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYTH4Q9UIA0 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYTH4Q9UIA0 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYTH4Q9UIA0 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYTH4Q9UIA0 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYTH4Q9UIA0 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYTH4Q9UIA0 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYTH4Q9UIA0 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYTH4Q9UIA0 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYTH4Q9UIA0 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYTH4Q9UIA0 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYTH4Q9UIA0 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYTH4Q9UIA0 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYTH4Q9UIA0 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYTH4Q9UIA0 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYTH4Q9UIA0 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYTH4Q9UIA0 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms