Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFMBT1Q9UHJ3 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms