Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms