Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTSFQ9UBX1 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms