Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms