Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1V8

SAMD15, Sterile alpha motif domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD15Q9P1V8 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD15Q9P1V8 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms