Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

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Length 571 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLHL28Q9NXS3 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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