Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms