Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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SNX15Q9NRS6 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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SNX15Q9NRS6 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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SNX15Q9NRS6 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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SNX15Q9NRS6 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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