Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms