Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZQ3

COMMD5, COMM domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD5Q9GZQ3 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC13□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
COMMD5Q9GZQ3 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms